[发明专利]一种检测OTC基因拷贝数变异的试剂盒

说明书

本发明公开了一种检测OTC基因拷贝数变异的试剂盒。所述试剂盒中含有如下引物对：Q‑OTC‑LF：AcacagcggtggagcttgCcAT，Q‑OTC‑LR：ActgcagggcagggtgtagCTgc，Q‑OTC‑MF：CCTTAGTAATTGCTACACATATCCG，Q‑OTC‑MR：CcgatccagctgagggtaagTGc，Q‑OTC‑RF：CCTAATTCACCTTCTCTAGGTCC，Q‑OTC‑RR：GAggtgagtaatctgtcagcTCgG。本发明简单快捷，预实验成本低，适用于小批量检测和验证。

技术领域

本发明属于生物医学检测技术领域，具体涉及一种检测OTC基因拷贝数变异的试剂盒。

背景技术

OTC基因如发生致病突变可引起鸟氨酸氨甲酰基转移酶缺乏症，通常以X染色体连锁隐性的方式遗传。该病主要表现为尿素循环代谢障碍，主要表现为高氨血症，脑病和呼吸性碱中毒三联征。新生儿发病可出现不愿进食、呼吸频率或体温控制不佳、昏迷等，进而可能引起癫痫发作、生长发育迟缓、进行性肝损坏等。成年期发病可表现为精神状态改变、行为不规律或意识下降、头痛、呕吐、癫痫发作等。约80％的OTC缺乏症患者OTC基因测序存在突变，5％-10％的OTC缺乏症患者OTC基因存在缺失/重复以及复杂的基因重排。

拷贝数变异(Copy number variation，CNV)一般是指长度为1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少，主要表现为亚显微水平的缺失、重复和倒位。与SNP相比，CNV数量虽然不多，但涉及更多的基因组序列，突变率更高。CNV是人类遗传多样性和个体间遗传差异的一个重要原因，除了一部分会致病以外也可以作为遗传多态性的一种。2004年，两项里程碑式的研究发现这种DNA拷贝数亚微观的变异(500kb)广泛存在于正常人类基因组中。

CNV是基因组结构变异(Structural variation，SV)的重要组成部分，过去几年中，随着基因组信息的不断挖掘以及检测技术的进步，CNV在遗传病发病中的作用越来越受到重视，其致病机制可能与基因剂量效应、基因断裂、基因融合和位置效应等有关。对CNV的深入研究，可能有助于更好的理解遗传性疾病的发病机制，有利于分子诊断和治疗手段的研究和开发。

基于PCR技术的方法中应用最为广泛的是qPCR，它利用相对定量实时PCR系统，对检测样本的目标基因(具有拷贝数多态)以及参照基因(无拷贝数多态)，利用2^-ΔΔCt相对定量分析法(Livak and Schmittgen，2001)进行拷贝数的分析。该方法简单易于操作，敏感性高，重复性好，速度快和污染少，但是不适合大样本的高通量检测。

发明内容

本发明旨在克服现有技术中的不足，提供一种检测OTC基因拷贝数变异的试剂盒。

为了达到上述目的，本发明提供的技术方案为：

所述检测OTC基因拷贝数变异的试剂盒中含有如下引物对：

Q-OTC-LF：ACACAGCGGTGGAGCTTGCCAT(SEQ ID NO.1)

Q-OTC-LR：ACTGCAGGGCAGGGTGTAGCTGC(SEQ ID NO.2)

Q-OTC-MF：CCTTAGTAATTGCTACACATATCCG(SEQ ID NO.3)

Q-OTC-MR：CCGATCCAGCTGAGGGTAAGTGC(SEQ ID NO.4)

Q-OTC-RF：CCTAATTCACCTTCTCTAGGTCC(SEQ ID NO.5)

Q-OTC-RR：GAGGTGAGTAATCTGTCAGCTCGG(SEQ ID NO.6)。

优选地，所述试剂盒中还含有内参引物对：