[发明专利]一种木霉属真菌tef1分子标记基因简并引物组及其应用在审
申请号: | 202011456879.2 | 申请日: | 2020-12-10 |
公开(公告)号: | CN112375842A | 公开(公告)日: | 2021-02-19 |
发明(设计)人: | 蔡枫;伊瑞娜·杜鲁兹尼娜 | 申请(专利权)人: | 奥世利华(苏州)微生物科技研究院有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 苏州欣达共创专利代理事务所(普通合伙) 32405 | 代理人: | 周升铭 |
地址: | 215000 江苏省苏州*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 木霉属 真菌 tef1 分子 标记 基因 引物 及其 应用 | ||
1.一种木霉属真菌tef1分子标记基因保守区域,其特征在于,包括SEQ ID NO.1和SEQID NO.2,所述SEQ ID NO.1为第四外显子3’端,核苷酸序列为:5’-RYRACAGCCAYGTSGACTCCGGMAAGTCKACCACCGTRAGT-3’,所述SEQ ID NO.2为第六外显子5’端:5’-AGACGCYCCCGGYCACCGTGAYTTCATCAAGAACATGATCACTGGTAC-3’;其中R=A/G,Y=C/T,S=C/G,M=A/C,K=G/T。
2.一种简并引物组,其特征在于,包括序列SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4,所述SEQ IDNO.3为正向引物,核苷酸序列为:5’-RYRACAGCCAYGTSGACTC-3’;所述SEQ ID NO.4为反向引物,核苷酸序列为:5’-GARGTACCAGTGATCATGTTCTTG-3’;其中,R=A/G,Y=C/T,S=C/G;优选的,用于扩增权利要求1所述的木霉属真菌tef1分子标记基因保守区域。
3.一种PCR反应体系,其特征在于,包括:模板DNA、DNA聚合酶、dNTPs、权利要求2所述的简并引物组和去离子水。
4.根据权利要求3所述的PCR反应体系,其特征在于,所述简并引物组引物终浓度为0.4μM。
5.根据权利要求3或4所述的PCR反应体系,其特征在于,所述模板DNA的终浓度为0.8-20ng/μl。
6.一种权利要求1所述的简并引物组或权利要求3-5任一项所述的PCR反应体系在木霉属真菌菌种鉴定领域的应用。
7.一种木霉属真菌菌种鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1使用如权利要求2所述的简并引物组为扩增引物或采用权利要求3-5任一项所述的PCR反应体系,对目标菌种的tef1分子标记基因有效片段进行PCR扩增;
S2将扩增产物进行凝胶电泳;
S3将经凝胶电泳确认后的产物测序,获得tef1分子标记基因有效片段的核苷酸序列,经过比对后确定目标菌种的种属。
8.根据权利要求7所述的木霉属真菌菌种鉴定方法,其特征在于,所述PCR扩增过程中预变性温度为94-95℃;退火温度为55-58℃,延伸温度为72℃。
9.一种木霉属真菌菌种鉴定试剂盒,其特征在于,包括权利要求2所述的简并引物组或权利要求3-5任一项所述的PCR反应体系。
10.一种权利要9所述木霉属真菌菌种鉴定试剂盒的使用方法,其特征在于,包括权利要求7或8所述的木霉属真菌菌种的鉴定方法。
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