[发明专利]一种原核生物来源的Argonaute蛋白及其应用有效
申请号: | 202011457521.1 | 申请日: | 2020-12-11 |
公开(公告)号: | CN112538470B | 公开(公告)日: | 2023-03-28 |
发明(设计)人: | 马立新;王亚平;刘洋;姜小满 | 申请(专利权)人: | 湖北大学 |
主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22;C12N15/55;C12P19/34;C12N15/63;C12N15/867 |
代理公司: | 重庆纵义天泽知识产权代理事务所(普通合伙) 50272 | 代理人: | 舒梦来 |
地址: | 430062 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 生物 来源 argonaute 蛋白 及其 应用 | ||
1.一种原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,所述Argonaute蛋白来源于中温原核生物kurthiamassiliensis,所述Argonaute蛋白简称pAgo,所述Argonaute蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述pAgo复合物的ssDNA向导的长度为9至50个核苷酸。
2.如权利要求1所述的原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,所述pAgo复合物的ssDNA向导的长度为12至30个核苷酸。
3.如权利要求1所述的原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,所述pAgo复合物的ssDNA向导的长度为15至20个核苷。
4.如权利要求3所述的原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,所述pAgo复合物的ssDNA向导的长度为16、18或20个核苷酸。
5.如权利要求1所述原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,pAgo在10至80℃具有核酸酶活性。
6.如权利要求5所述原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,pAgo在37℃下具有核酸酶活性。
7.如权利要求1-6任一项所述原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,pAgo以及pAgo复合物的靶RNA没有高级结构;或,有高级结构;或,为双链RNA;或,为体外转录的RNA;或,为病毒基因组RNA;或,为信使RNA;或,为细胞内的其他RNA。
8.如权利要求7所述原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,pAgo以及pAgo复合物的向导是5’末端磷酸化的ssDNA;或,5’末端羟基化的ssDNA;或,5’末端磷酸化的RNA。
9.如权利要求8所述原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,pAgo以及pAgo复合物的核酸酶活性需要存在至少一种阳离子选自Mn2+,Mg2+,Ca2+,Cu2+,Fe2+,Co2+,Zn2+和Ni2+组成的组。
10.如权利要求9所述原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,pAgo以及pAgo复合物的pAgo是提取的;或,是合成的。
11.如权利要求10所述原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物,其特征在于,pAgo靶DNA是ssDNA或双链DNA中的一种。
12.一种编码如权利要求11所述原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物的多核苷酸。
13.一种基于如权利要求4所述原核生物来源的Argonaute蛋白形成的pAgo复合物的体外切割RNA的方法,其特征在于,所述体外切割RNA的方法包括:
步骤一,基于pAgo和ssDNA向导形成pAgo-向导复合物;
步骤二,令所得的pAgo-向导复合物与靶RNA接触,所述靶RNA具有与所述向导序列大部分互补的核苷酸序列,所述pAgo-向导复合物在特定位点切割靶RNA。
14.一种包含如权利要求12所述多核苷酸的表达载体。
15.一种包含如权利要求14所述表达载体的病毒载体。
16.如权利要求14所述病毒载体,其特征在于,所述病毒载体是慢病毒载体或逆转录病毒载体。
17.一种包含如权利要求9所述pAgo复合物的试剂盒。
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