[发明专利]一种交联剂及其制备与在质谱交联技术中的应用有效

专利信息
申请号: 202011463426.2 申请日: 2020-12-14
公开(公告)号: CN112694499B 公开(公告)日: 2023-09-19
发明(设计)人: 姜标;陈红莉;陈文章 申请(专利权)人: 上海科技大学
主分类号: C07F9/38 分类号: C07F9/38;G01N33/68
代理公司: 上海申汇专利代理有限公司 31001 代理人: 徐俊
地址: 201210 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 交联剂 及其 制备 交联 技术 中的 应用
【说明书】:

发明涉及一种交联剂及其制备与在质谱交联技术中的应用,属生物技术研究与开发领域。本发明提供一种交联剂及其制备方法以及其在质谱交联技术中的应用。利用该交联剂本发明提供了一种肽段分析的策略,提出了一种解析质谱交联肽段的方法;本发明提供的交联剂与蛋白交联后,没有任何副产物产生;提供的交联剂含有可富集的官能团;交联剂具有在CID模式下保持稳定,但能够在HCD模式下具有质谱可断裂性的特征;本发明提供的解析质谱交联肽段的策略,可以极大的减少数据处理时间并提高数据分析处理的灵敏度。

技术领域

本发明涉及一种交联剂及其制备与在质谱交联技术中的应用,属生物技术研究与开发领域。

背景技术

质谱交联技术是近些年发展起来的新技术,它是通过化学交联的方法,将蛋白质中距离接近、存在相互作用的位点进行共价连接,然后结合质谱技术进行交联肽段分析,以便全面了解生物体内目标功能体系的蛋白结构与相互作用信息。在该技术中,如何设计并使用交联剂对后续的处理和结果有非常大的影响。

为了解决从大量的数据中有效的提取并解读交联肽段的信息,新的交联剂及计算方法不断发展,尤其是质谱条件下可解离的交联剂以及亲和标签的引入可以大大提高数据处理的效率。本发明提供一种新的交联剂,它是一种可富集且质谱可断裂型交联剂;它在一般碰撞诱导中保持稳定(collision-induced dissociation,CID),但能够在高能碰撞诱导下解离(high energy collision-induced dissociation,HCD)。同时利用该交联剂的这一特征,我们发展了一种新的数据分析策略,可以极大的提高数据处理效率。

发明内容

本发明的目的提供一类可富集且质谱可断裂型交联剂的制备及其在质谱交联技术中的应用。同时可解决如何从大量的数据中有效的提取并解读交联肽段的信息,提高数据处理效率的技术问题。

为达到解决上述问题的目的,本发明所采取的技术方案是提供一种交联剂,其化学结构如式(I)所示;

其中,X选自C,N。

优选地,交联剂包括化合物式I的盐或者溶剂合物。

优选地,所述化合物式I的盐设为钠盐或钾盐;所述化合物式I中乙烯基磺酰胺取代基位于磷酸基的邻位、间位或对位。

本发明提供一种交联剂的制备方法,包括以下步骤:

步骤1:将式II化合物与亚磷酸酯在催化剂、碱和溶剂下合成式III化合物;

步骤2:将步骤1合成的式III化合物与2-氯乙基磺酰氯在碱和溶剂下合成式IV;

步骤3:将步骤2合成的式IV合物进一步合成式Ⅰ化合物;

所述步骤1至步骤3中,X选自C,N,;Y选自卤族元素或三氟甲磺酸酯;R选自甲基、乙基、苄基。

优选地,所述交联剂具有在CID模式下保持稳定,但能够在HCD模式下质谱可断裂性的特征。

本发明提供的一种新的交联剂的制备。

本发明提供的一种交联剂在蛋白质交联反应中的应用。

本发明提供的一种交联剂在研究蛋白质结构或蛋白质相互作用中的应用。

本发明提供的一种交联剂在解析质谱交联肽段中的应用。

本发明提供了一种交联剂及其制备方法与在质谱交联技术中的应用。同时利用该交联剂本发明提供了一种策略,提出了一种解析质谱交联肽段的新方法。本发明提供的方法可以极大的提高数据处理效率。

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