[发明专利]基于容器技术的生信分析任务调度系统及其搭建方法、调度方案

权利要求书

1.一种基于容器技术的生信分析任务调度系统，包括：分析镜像仓库模块，镜像智能拉取模块，任务调度模块，任务运行模块；其中，

所述分析镜像仓库模块，分为用户镜像仓库和系统镜像仓库，用于存储分析人员构建的生信分析镜像，支持项目和用户权限隔离，提供用户管理、访问控制和活动审计的高级安全特性，并且系统镜像仓库和用户镜像仓库定时进行主从备份；

所述镜像智能拉取模块，用于自动检测当前本地主机是否具备生信分析需要的指定分析镜像，本地主机不具备该分析镜像则自动搜索系统镜像仓库，在系统镜像仓库中检测到指定分析镜像存在则自动拉取到本地主机，如不存在则直接终止生信分析任务的运行；

所述任务调度模块，调用内部脚本读取分布式系统Celery的环境变量配置，调用预设的任务调度模板，通过任务生成脚本生成新任务，并建立任务与对应任务运行模块逻辑函数之间的对应关系；

所述任务运行模块，接受到任务调度模块分发的任务，自动执行预设的任务运行脚本代码处理分析任务。

2.根据权利要求1所述的生信分析任务调度系统，其特征在于，所述分析镜像仓库模块实现项目和用户权限的隔离，还包括定制化用户仓库和系统仓库备份的主从复制逻辑，能够对用户仓库和系统仓库的敏感操作进行隔离。

3.根据权利要求1所述的生信分析任务调度系统，其特征在于，所述镜像智能拉取模块对Docker和Harbor操作进行定制化开发，提供可视化的管理界面，支持查看当前本地主机镜像情况。

4.根据权利要求3所述的生信分析任务调度系统，其特征在于，所述Docker和Harbor操作的定制化开发，既封装了Docker自身执行命令嵌入镜像智能拉取模块，又将Harbor镜像仓库的API接口嵌入镜像智能拉取模块，用户通过镜像智能拉取模块实时获取仓库信息。

5.根据权利要求1所述的生信分析任务调度系统，其特征在于，所述任务调度模块的个性化配置通过配置Celery的参数和编写相关业务代码，解决生信分析过程中的计算资源浪费或者挤兑的现象。

6.根据权利要求1所述的生信分析任务调度系统，其特征在于，所述任务运行模块将网页传入的生信分析要求自动解析为参数，包装为Docker的执行命令进行生信分析任务，同时支持对任务的执行情况进行实时监控。

7.根据权利要求6所述的对任务的生信分析任务调度系统，其特征在于，所述执行情况进行实时监控中，所述任务运行模块集成了Celery的监控工具Flower，对各个生信分析任务的执行情况和健康状况进行可视化查看；和/或，

所述Docker执行命令进行生信分析任务中，每个生信分析任务均建立特定的临时文件夹，用于接收分析镜像容器中执行生信分析任务的结果输出，在分析任务全部完成后存入文件系统中。

8.一种如权利要求1-7之任一项所述的基于容器技术的生信分析任务调度系统搭建方法，其特征在于，所述方法包括步骤包括：

步骤一：在需要运行分析任务的主机上安装Docker引擎，并启动；

步骤二：搭建分析镜像仓库模块；

步骤三：编写生信分析流程依赖的系统环境和软件的Dockerfile文件，构建个性化的版本镜像，上传用户镜像仓库；

步骤四：搭建任务调度模块；

步骤五：搭建任务运行模块，编写可视化的网页前端界面，支持分析信息的填写。