[发明专利]一种基于Cytb基因序列的飘鱼和寡鳞飘鱼的分子鉴别方法在审
申请号: | 202011470635.X | 申请日: | 2020-12-14 |
公开(公告)号: | CN112575092A | 公开(公告)日: | 2021-03-30 |
发明(设计)人: | 李大命;张彤晴;唐晟凯;刘燕山;谷先坤;殷稼雯;蒋琦辰;刘小维 | 申请(专利权)人: | 江苏省淡水水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 南京瑞弘专利商标事务所(普通合伙) 32249 | 代理人: | 徐激波 |
地址: | 210017 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 cytb 基因 序列 寡鳞飘鱼 分子 鉴别方法 | ||
1.一种飘鱼和寡鳞飘鱼的分子鉴别方法,其特征在于:包含以下步骤,
(1)分别提取待鉴定的飘鱼和寡鳞飘鱼基因组DNA;
(2)以提取的基因组DNA为模板,PCR扩增飘鱼和寡鳞飘鱼的细胞色素b基因Ctyb,上游引物的序列如SEQ ID NO.1所示,下游引物的序列如SEQ ID NO.2所示;
(3)扩增产物纯化后,直接测序,飘鱼的Cytb基因扩增产物如SEQ ID NO.3所示, 寡鳞飘鱼的Cytb基因扩增产物如SEQ ID NO.4所示; Cytb基因第57位点碱基是C的为飘鱼,若该位点是T的为寡鳞飘鱼。
2.根据权利要求1所述的飘鱼和寡鳞飘鱼的分子鉴别方法,其特征在于:所述的PCR的反应体系为50 mL: 100ng/μL的模板DNA 1 mL,PCR缓冲液 5 mL,dNTP混合液4 mL,每种dNTP 0.1mmol/L, 10 μmol/L的上、下游引物各1 mL,2mL 2.5 IU的Taq酶;双蒸水36mL;所述的PCR缓冲液由10mmol/L Tris-HCl,pH9.0, 0.5mmol/L KCl,30mmol/L MgCl2,0.01%(g/100ml)明胶组成;PCR扩增反应程序为:94 ℃预变性4 min,94 ℃变性40 s,56 ℃退火50s,72 ℃延伸90 s,经30个循环后再72 ℃延伸10 min。
3.一种用于飘鱼和寡鳞飘鱼的分子鉴别的引物对,其特征在于:上游引物的序列如SEQID NO.1所示,下游引物的序列如SEQ ID NO.2所示。
4.权利要求3所述的引物对在分子遗传鉴别飘鱼和寡鳞飘鱼中的应用。
5.权利要求3所述的引物对在制备飘鱼和寡鳞飘鱼分子鉴别试剂中的应用。
6.一种飘鱼和寡鳞飘鱼分子鉴别试剂,其特征在于:包含权利要求3所述的引物对。
7.根据权利要求6所述的飘鱼和寡鳞飘鱼分子鉴别试剂,其特征在于:所述的飘鱼和寡鳞飘鱼分子鉴别试剂还包括PCR缓冲液和dNTP混合液,所述的PCR缓冲液由10mmol/L Tris-HCl,pH9.0, 0.5mmol/L KCl,30mmol/L MgCl2,0.01%明胶组成。
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