[发明专利]一种与绵羊多羔相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明提供了一种与绵羊多羔性状相关的SNP分子标记及其检测试剂盒和应用，属于绵羊SNP分子标记技术领域。所述SNP为第21号染色体上第41895346bp位点(XM_004019650.3，基于绵羊基因组序列信息版本号Oar_v3.1，2012年12月)，通过对该位点进行分型选择该位点优势等位基因，提高绵羊经产母羊窝平均产羔数。本发明进一步利用Sequenom技术对该位点进行单核苷酸型检测，判定绵羊BAD基因型，选择具有高产羔数性状的TC杂合个体和CC纯合个体留下来用作配种，实现大规模、自动化检测，对绵羊大规模分子育种具有潜在应用价值。

技术领域

本发明涉及分子标记检测技术，具体涉及一种与绵羊多羔相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

绵羊(Ovis aries)是常见的饲养动物，世界各地均有饲养，可以为人类提供肉和毛皮等产品。产羔数性状是绵羊最重要的经济性状之一，因其受微效多基因控制且遗传力低，难以用常规育种方法来快速改良，而分子技术能有效快速地提高其遗传进展，因此，鉴定与产羔数相关的主效基因或分子遗传标记是现代分子育种的关键。

BAD蛋白是B细胞淋巴瘤-2(B cell lymphoma-2,Bcl-2)蛋白家族成员之一。Bcl-2相关细胞凋亡促进因子(Bcl-2-associated agonist of cell death,BAD)属于Bcl-2家族，是仅含BH3结构域的促凋亡蛋白，能够与Bcl-2、Bcl-xL结合成为异源二聚体。通过竞争结合中和Bcl-2、Bcl-xL、Bcl-W，抑制其功能，从而释放凋亡效应蛋白Bax和Bak，促进凋亡。而发生这一系列生物学过程的场所卵巢则通过凋亡调控不同发育阶段卵泡数目、大小和质量，来准确控制繁殖的时间和质量。

狄冉等通过高通量测序研究显示不同季节的BAD基因表达有显著差异，McNatty等也报道卵巢颗粒细胞在季节性繁殖期间显示出功能变化。曹晓涵等研究发现在小尾寒羊卵泡颗粒细胞中，BAD基因过表达后细胞凋亡显著增加，Mok等研究表明BAD基因的过表达可促进细胞周期进程，以上研究结果提示BAD基因在促进细胞凋亡和调节细胞周期中起重要作用。

王龙涛等研究了在小尾寒羊卵泡期卵巢膜细胞、输卵管和子宫三个组织BAD基因的表达规律，结果表明BAD基因在这三个组织都有不同程度的表达，在输卵管表达量最高，卵巢膜细胞表达量次之，子宫表达量最低，曹晓涵等研究也显示BAD基因在这三个组织中的表达量呈现输卵管卵巢子宫体的趋势。

然而，目前关于BAD基因在绵羊繁殖过程中的具体作用并无报道，传统的基因型检测方法大多采用PCR-RFLP(polymerase chain reaction-restriction fragment lengthpolymorphism)和PCR-SSCP(polymerase chain reaction-single strand conformationpolymorphism)检测方法，这些方法通量较低，程序繁多，较难实现高通量自动化测定。因此，探究BAD基因与绵羊产羔数相关的分子标记，开发一种BAD基因型的SNP位点高通量、自动化检测方法成为本领域迫切需要解决的一个技术问题。

发明内容

为了解决现有技术中存在的问题，本发明的目的在于提供一种与绵羊多羔相关的SNP分子标记及其应用，通过对绵羊基因组序列信息版本号Oar_v3.1的第21号染色体上第41895346bp位点进行检测、分型，选择该位点优势等位基因，提高绵羊经产母羊窝平均产羔数。

为了实现上述发明目的，本发明提供以下技术方案：

本发明提供了一种与绵羊多羔相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于绵羊基因组序列信息版本号Oar_v3.1的第21号染色体上第41895346bp位点，该位点存在T/C碱基突变。