[发明专利]小麦产量相关基因TaD11-2A的分子标记及其应用

说明书

本发明属于植物变异或遗传工程领域，公开了一种小麦产量相关基因TaD11‑2A的分子标记及其应用，所述分子标记为TaD11‑ID3，所述分子标记TaD11‑ID3的特异性引物为TaD11‑ID3‑1F和TaD11‑ID3‑1R，所述TaD11‑ID3‑1R的序列如SEQ ID NO：1所示，所述TaD11‑ID3‑1F的序列如SEQ ID NO：2所示。本发明从小麦自然群体中发掘TaD11‑2A的优异等位基因，开发了用于鉴定小麦穗长、小穗数和穗粒数的相关功能性分子标记，为小麦产量性状的遗传改良提供基因资源和有效途径。

技术领域

本发明属于植物变异或遗传工程领域，具体涉及一种小麦产量相关基因TaD11-2A的分子标记及其应用。

背景技术

小麦（Triticum aestivum L.）是世界上最重要的粮食作物，为人类提供20%能量。提高作物产量以适应全球人口增加与社会发展的需要仍是目前的主流（Senthold Assenget al., 2020）。传统育种鉴定表型工作量大、成本高且周期过长，基因功能标记的开发为小麦遗传改良及新种质的开发提供了一个可靠的分子标记工具箱，最大限度降低成本（Rasheed et., 2016）。

油菜素内酯（brassinosteroids, BRs）是一种新型的植物内源激素，在促进作物生长和提高作物产量上发挥着重要作用。OsD11是水稻中BR生物合成途径的关键基因，研究发现OsD11可显著地提高水稻籽粒大小和单株产量（Wu et al., 2016）。然而，目前尚未发现小麦TaD11基因的功能研究报道和分子标记应用。

发明内容

针对现有技术存在的上述不足，本发明的目的是提供一种小麦产量相关基因TaD11-2A的分子标记及其应用，为小麦产量性状的遗传改良提供基因资源和有效途径。

为实现以上目的，本发明一方面提供一种小麦产量相关基因TaD11-2A的分子标记，采用如下技术方案：

一种小麦产量相关基因TaD11-2A的分子标记，所述分子标记为TaD11-ID3，所述分子标记TaD11-ID3的特异性引物为TaD11-ID3-1F 和TaD11-ID3-1R，所述TaD11-ID3-1R的序列如SEQ ID NO：1所示，所述TaD11-ID3-1F的序列如SEQ ID NO：2所示。

本发明另一方面提供所述小麦产量相关基因TaD11-2A的分子标记在鉴定小麦产量性状中的应用。

本发明还提供一种根据小麦TaD11-2A基因组序列设计的引物用于进行扩增测序，所述引物为SeqD11-2A-1F和SeqD11-2A-1R，以及SeqD11-2A-2F和SeqD11-2A-2R，所述SeqD11-2A-1F、SeqD11-2A-1R、 SeqD11-2A-2F和SeqD11-2A-2R的序列分别如SEQ ID NO：3~SEQ ID NO：6所示。

所述TaD11-2A基因区序列中存在3个SNP和1个3-bp InDel，共2种单倍型Hapl a和Hapl b。

进一步的，所述TaD11-2A的基因区序列中的3个SNP和1个3-bp InDel位点完全共分离。

所述TaD11-2A基因组序列如SEQ ID NO：7所示。