[发明专利]一种基于深度学习的细胞微核识别、定位和计数方法在审
申请号: | 202011508857.6 | 申请日: | 2020-12-18 |
公开(公告)号: | CN112613505A | 公开(公告)日: | 2021-04-06 |
发明(设计)人: | 郑晓亮;王飞;周昕;王日晟;姚剑波 | 申请(专利权)人: | 安徽丹姆斯生物科技有限公司 |
主分类号: | G06K9/32 | 分类号: | G06K9/32;G06K9/46 |
代理公司: | 合肥洪雷知识产权代理事务所(普通合伙) 34164 | 代理人: | 徐赣林 |
地址: | 230000 安徽省合肥市合肥高新技术开*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 深度 学习 细胞 识别 定位 计数 方法 | ||
本发明公开了一种基于深度学习的细胞微核识别、定位和计数方法,涉及细胞微核检测技术领域。本发明包括构建深度学习特征提取网络模型C、构建细胞微核识别定位网络模型D、将C和D串联记为深度学习细胞微核识别定位网络模型E。本发明通过构建深度学习细胞微核识别定位网络模型E,运用了卷积操作、特征图的批归一化操作、非线性映射操作、池化操作以及非极大值抑制算法,省去了人工阅片的繁琐过程,提高了微核检测的效率;提高了微核计数准确率,能更加准确的反应细胞的变异情况。
技术领域
本发明属于细胞微核检测技术领域,特别是涉及一种基于深度学习的细胞微核识别、定位和计数方法。
背景技术
科技活动带来的有害物理、化学和生物因子会对人的遗传物质造成损害,导致癌症病发率增高,体外微核检测是遗传毒理重要的评价方法之一,广泛用于放射性接触人员辐射效应的健康监护、人群遗传稳定性的健康筛查、药物的临床遗传毒理评价等,具有极高的临床应用价值。传统的微核检测采用人工显微镜阅片,耗时费力,效率低下,准确性也难也保证。微核的自动化检测技术是目前重要的发展方向,智能化的图像分析和结果判断能大大加快检测通量和结果的标准化。目前国内关于智能化图像处理的体外微核检测方法尚属空白。
现有的微核检测方法主要分为三种:(一)人工显微镜阅片;(二)流式细胞仪检测;(三)激光扫描仪检测。
人工显微镜阅片是指采用细胞质阻断方法制备微核检测图片,在显微镜下根据双核、微核、核质桥和树突特征及人工识别标准由工作人员主观判断细胞微核类别。人工显微镜阅片方法虽然程序简单,但存在一些明显的缺陷:
1、人工阅片时间长,费时费力,工作效率较为低下。
2、人工阅片的准确性依赖于检测人员的水平,而在目前需大量进行该试验的情况下,检测人员水平不一,将导致检测结果具有很大的主观性。
3、微核的发生率低,能否检出小的微核升高率的能力受到计数误差以及个体之间差异性的限制,能否检测出小的微核升高率的灵敏度受到低微核数的计数误差的限制。微核实验中需尽可能计数足够数量的细胞,以使计数误差低于个体间微核率的变异性。
流式细胞仪检测是指对待测样本用荧光染色后,以激光束作为光源。把待测样本单个通过喷嘴,激光照射到样本时,就能使荧光染色材料产生荧光,然后光学系统采集这些信号并且转化为电信号,从而能够定量测定待测样本中的细胞数目。工作原理如附图中的图1所示,对细胞进行染色后再由显微镜观察。但流式细胞仪主要用于无核细胞中的微核检测,难以用于双核和多核细胞中的微核检测。
激光扫描仪检测是指细胞培养后,对细胞进行洗涤,低渗、固定、染色;接入激光扫描仪,设置参数,检测核和微核的红色荧光信号强度及绿色荧光信号强度;根据从光电倍增管测量PI的红色荧光的数据设置“阈值”轮廓。然后将“积分”轮廓设置在阈值轮廓之外的零到两个像素之间的范围内。这样,与核的DNA和蛋白质相关的荧光强度以及微核的积分值记录在同一文件中。然后基于核和微核的DNA含量差异来区分核和微核。激光扫描仪仅见报道用于小鼠体内和体外红细胞的微核检测。
发明内容
本发明的目的在于提供一种基于深度学习的细胞微核识别、定位和计数方法,通过构建深度学习细胞微核识别定位网络模型E,解决了现有的微核检测方法费时费力,工作效率低;检测准确率低以及国内关于智能化图像处理的体外微核检测方法尚属空白的问题。
为解决上述技术问题,本发明是通过以下技术方案实现的:
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