[发明专利]水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记及其应用有效
申请号: | 202011531956.6 | 申请日: | 2020-12-21 |
公开(公告)号: | CN112680537B | 公开(公告)日: | 2021-10-08 |
发明(设计)人: | 杨勤忠;刘树芳;董丽英;周伍民;李迅东;曾莉 | 申请(专利权)人: | 云南省农业科学院农业环境资源研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 云南凌云律师事务所 53207 | 代理人: | 康珉 |
地址: | 650205 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水稻 广谱 稻瘟病 基因 pi57 分离 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57-InDel-1,其特征在于,所述水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57-InDel-1的片段长度为132bp,其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:1所示。
2.一种水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57-InDel-2,其特征在于,所述水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57-InDel-2的片段长度为143bp,其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:2所示。
3.权利要求要求1所述的水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57-InDel-1在水稻抗稻瘟病育种中的应用。
4.权利要求要求2所述的水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57-InDel-2在水稻抗稻瘟病育种中的应用。
5.用于扩增权利要求1所述的水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57-InDel-1的引物对,其特征在于,所述引物对为Pi57-InDel-1FW引物和Pi57-InDel-1RV引物,所述Pi57-InDel-1FW引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,Pi57-InDel-1RV引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。
6.用于扩增权利要求2所述的水稻广谱抗稻瘟病基因Pi57的共分离分子标记Pi57-InDel-2的引物对,其特征在于,所述引物对为Pi57-InDel-2FW引物和Pi57-InDel-2RV引物,所述Pi57-InDel-2FW引物的核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:5所示,Pi57-InDel-2RV引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示。
7.权利要求5所述的引物对在水稻抗稻瘟病育种中的应用。
8.权利要求6所述的引物对在水稻抗稻瘟病育种中的应用。
9.根据权利要求7或8所述的应用,其特征在于,
(1)当用Pi57-InDel-1FW引物和Pi57-InDel-1RV引物通过PCR扩增目标水稻材料,目标水稻材料中扩增出132bp的片段,则目标水稻材料含有抗稻瘟病基因Pi57位点;用Pi57-InDel-1FW引物和Pi57-InDel-1RV引物通过PCR扩增目标水稻材料,目标水稻材料中扩增出129bp的片段,则目标水稻材料不含有抗稻瘟病基因Pi57位点;用Pi57-InDel-1FW引物和Pi57-InDel-1RV引物通过PCR扩增目标水稻材料,目标水稻材料中同时扩增出132bp和129bp两个片段,则目标水稻材料为含有抗稻瘟病基因Pi57位点的杂合水稻材料;
或(2)用Pi57-InDel-2FW引物和Pi57-InDel-2RV引物通过PCR扩增目标水稻材料,目标水稻材料中扩增出143bp的片段,则目标水稻材料含有抗稻瘟病基因Pi57位点;用Pi57-InDel-2FW引物和Pi57-InDel-2RV引物通过PCR扩增目标水稻材料,目标水稻材料中扩增出185bp的片段,则目标水稻材料不含有抗稻瘟病基因Pi57位点;用Pi57-InDel-2FW引物和Pi57-InDel-2RV引物通过PCR扩增目标水稻材料,目标水稻材料中同时扩增出143bp和185bp两个片段,则目标水稻材料为含有抗稻瘟病基因Pi57位点的杂合水稻材料。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于:
用Pi57-InDel-1FW引物和Pi57-InDel-1RV引物的PCR扩增反应体系20μL,其中含有2×ES Taq Master Mix 10μL、10μM Pi57-InDel-1FW引物1μL、10μM Pi57-InDel-1RV引物1μL、10ng/μL模板DNA 1μL,ddH2O 7μL;PCR扩增的反应条件为:95℃预变性3min;95℃变性30s,61℃退火30s,72℃延伸1min,共32个循环;最终72℃延伸5min;
用Pi57-InDel-2FW引物和Pi57-InDel-2RV引物的PCR扩增反应体系20μL,其中含有2×ES Taq Master Mix 10μL、10μM Pi57-InDel-2FW引物1μL、10μM Pi57-InDel-2RV引物1μL、10ng/μL模板DNA 1μL,ddH2O 7μL;PCR扩增的反应条件为:95℃预变性3min;95℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸1min,共32个循环;最终72℃延伸5min。
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