[发明专利]基于网络药理学评价金莲清热制剂抗新型冠状肺炎的方法在审
申请号: | 202011535685.1 | 申请日: | 2020-12-23 |
公开(公告)号: | CN114664459A | 公开(公告)日: | 2022-06-24 |
发明(设计)人: | 窦啟玲;窦雅琪;耿丽波;于宁 | 申请(专利权)人: | 贵州益佰制药股份有限公司 |
主分类号: | G16H50/80 | 分类号: | G16H50/80;G16H70/40 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 550008 贵州省*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 网络 药理学 评价 金莲 清热 制剂 新型 冠状 肺炎 方法 | ||
本发明属于医药技术领域,尤其涉及一种基于网络药理学评价金莲清热制剂抗新型冠状肺炎的方法。本发明使用TCMSP、PubChem数据库获取金莲清热制剂的有效成分,并以口服吸收利用度、类药性对活性成分做初步筛选并获取结构成分;通过Swiss Target Prediction预测潜在活性成分的靶点信息;通过GeneCards检索汇总新冠肺炎相关靶点;成分靶点和疾病靶点通过映射后导入STRING平台和DAVID平台构建PPI和富集分析,最后将核心靶点与成分进行分子对接以初步验证靶点的可靠性。本发明操作简便,能快速解决金莲清热制剂抗新型冠状肺炎药效物质基础和作用机理不清楚的问题。
技术领域
本发明属于医药技术领域,尤其涉及一种基于网络药理学评价金莲清热制剂抗新型冠状肺炎的方法。
背景技术
新型冠状病毒肺炎(COVID-19)是由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染导致的以发热、咳嗽或干咳、腹泻为主要标志的急性呼吸道传染病,可影响胃肠道,以及神经和肝系统等。病程后期患者会出现高热、急性呼吸窘迫症以及炎性因子风暴等症,危及生命。国家卫健委及国家中医药管理局发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案》中指出应推荐使用不同的复方中成药对症治疗。因此研究对症中药复方具有重要意义。金莲清热泡腾片由金莲花、苦杏仁、大青叶、玄参、地黄、知母和石膏组方而成,具清热解毒、止咳利咽、生津除痰之功效,临床常用于高热、咽干痛、咳嗽粘稠的患者,接受度较高。金莲清热泡腾片以《伤寒论》中白虎汤和增液汤二方整合优化而来,对病毒引发的高热的恢复以及提高巨噬细胞吞噬能力和淋巴细胞的活性具有良好的临床效果。
网络药理学基于系统生物学和多向药理学,能从整体水平考察“药物-靶点-疾病”的复杂关系,进而指导新药研发及探究机理过程。结合运用分子对接,能够快速筛选新药临床实验的成功率,节省药物研发的时间与资金成本。金莲清热泡腾片在2020年新冠疫情中被推荐用于辅助治疗新冠肺炎,但其作用药效物质基础和作用机理不清楚,针对该问题,本发明是以中药复方网络药理学“药物-成分-靶点-疾病”为基本思路,对金莲清热泡腾片治疗新型冠状病毒肺炎以及发热症的潜在活性成分、作用靶点以及相关通路进行了整合分析。
发明内容
本发明是针对金莲清热制剂治疗新冠肺炎的药效物质基础和作用机理不清楚的问题通过网络药理学评价方法加以分析,初步阐明治疗新冠肺炎的分子机制以及预后对高热症状的作用机理,为临床使用提供参考。具体方法为:
一种基于网络药理学评价金莲清热制剂抗新型冠状肺炎的方法,其特征在于,所述方法包含以下步骤:
首先获取金莲清热制剂药效成分靶点及新冠肺炎作用靶点;
构建金莲清热制剂抗新型冠状肺炎及其发热症的潜在作用靶点互作网络和潜在药效成分-作用靶点网络,找到潜在作用靶点蛋白互作关系;
对靶点进行GO分析和KEGG富集分析,找出核心靶点;
将核心靶点与活性成份进行分子对接,验证作用靶点及药效归属。
其中,所述步骤具体方法为:从TCMSP 数据库获取金莲清热制剂所含药材的化学成分,设置口服生物利用度大于30% 和类药性大于0.18 ,筛选并建立金莲清热制剂的药效成分库;再利用PubChem 数据库获取药效成分的Canonical SMILES 序列并导入SwissTargetPrediction 数据库,设置种属为“Homo sapiens”,取可能性分值大于0作为药效成分靶点;最后在GeneCards 数据库中以“COVID-19”、“SARS-CoV-2”为关健词检索新型冠状病毒肺炎相关靶点,以“Febrile”、“Heat generation”为关键词检索发热相关靶点,将新型冠状病毒肺炎和发热相关检索项下相关性分数大于均值的相关靶点合并,共同作为二者的作用靶点。
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