[发明专利]一种用于检测牛结节性皮肤病病毒的荧光型RAA试剂盒及其检测方法和应用有效
申请号: | 202011537202.1 | 申请日: | 2020-12-23 |
公开(公告)号: | CN112646927B | 公开(公告)日: | 2023-02-28 |
发明(设计)人: | 翟少伦;娄亚坤;魏文康;吕殿红;温肖会;翟颀;杨楠 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院动物卫生研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 庆之 |
地址: | 510640 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 结节 皮肤病 病毒 荧光 raa 试剂盒 及其 方法 应用 | ||
1.一种检测试剂,其特征在于,所述试剂中含有特异性引物组和RAA-exo探针;
所述特异性引物组用于特异性扩增牛结节性皮肤病病毒ORF132基因;
所述特异性引物组的核苷酸序列如下所示:
HW-LSD-F:5′-TATAMTGGTCTATTTTTAACTTTTTTATGCAAT-3′;
HW-LSD-R:5′-GARAACAACACTTTTTCCTTATCTAAAGAGRC-3′;
所述RAA-exo探针靶向牛结节性皮肤病病毒ORF132基因;
所述RAA-exo探针的核苷酸序列如下所示:
HW-LSD-LP:5′-TAATTCACTTTTAACTTTTTTATTATTAACTCCATCGATACATGTA-3′;
所述RAA-exo探针按照5’至3’的顺序在第31位碱基T后依次连接荧光基团、THF残基、猝灭基团;
所述荧光基团选自FAM、Alexa400和CF400;
所述猝灭基团选自BHQ-1和Eclipso。
2.一种检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒中含有权利要求1所述的检测试剂。
3.根据权利要求2所述的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒中还含有重组酶、单链结合蛋白、链置换DNA聚合酶、Buffer A、Buffer B、阴性对照和阳性对照;
其中,所述Buffer A为水解缓冲液;
所述Buffer B为醋酸镁溶液。
4.根据权利要求2或3所述的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的使用方法包括以下步骤:
(1)提取样品DNA;
(2)使用权利要求2或3所述的试剂盒对步骤(1)所得样品DNA进行RAA扩增;
(3)根据扩增结果,判读样品中是否含有牛结节性皮肤病病毒;
其中,所述RAA扩增体系为:
其中,所述Buffer A为水解缓冲液;
所述Buffer B为醋酸镁溶液;
扩增反应条件为:
37~42℃,40秒;37~42℃,30秒;40个循环;
步骤(3)中判读样品中是否含有牛结节性皮肤病病毒的标准为:
当阳性对照有扩增曲线,且出峰时间≤15min或Ct值≤30;和
阴性对照无扩增曲线,或出峰时间≥20min或Ct值≥40时,
若所述样品出峰时间≤17.5 min或Ct值35,判断为阳性,所述样品含有牛结节性皮肤病病毒;
若所述样品出峰时间≥20 min或Ct值≥40,判断为阴性,所述样品不含有牛结节性皮肤病病毒;
否则,重新检测所述样品。
5.特异性引物组和RAA-exo探针在制备牛结节性皮肤病病毒检测制剂中的应用;
所述特异性引物组用于特异性扩增牛结节性皮肤病病毒ORF132基因;
所述特异性引物组的核苷酸序列如下所示:
HW-LSD-F:5′-TATAMTGGTCTATTTTTAACTTTTTTATGCAAT-3′;
HW-LSD-R:5′-GARAACAACACTTTTTCCTTATCTAAAGAGRC-3′;
所述RAA-exo探针靶向牛结节性皮肤病病毒ORF132基因;
所述RAA-exo探针的核苷酸序列如下所示:
HW-LSD-LP:5′-TAATTCACTTTTAACTTTTTTATTATTAACTCCATCGATACATGTA-3′;
所述RAA-exo探针按照5’至3’的顺序在第31位碱基T后依次连接荧光基团、THF残基、猝灭基团;
所述荧光基团选自FAM、Alexa400和CF400;
所述猝灭基团选自BHQ-1和Eclipso。
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