[发明专利]一种检测甲状腺癌靶向用药相关基因变异的引物及试剂盒

说明书

本发明公开了一种检测甲状腺癌靶向用药相关基因变异的引物及试剂盒。本发明可以同时检测14个基因的32个位点的变异以及6个融合基因变异，其中包括BRAF基因、RET基因、KRAS基因、HRAS基因、NRAS基因、FLT3基因、KIT基因、TET2基因、PDGFR‑α基因、LRP1B基因、PIK3CA基因、PTEN基因、MAP2K1基因、MAP2K2基因和RET/CCDC6融合、RET/NCOA4融合、NTRK1/TPM3融合、NACC2/NTRK2融合、NTRK2/QKI融合、NTRK3/ETV6融合。这些基因的热点突变和融合变异，都与甲状腺癌靶向用药密切相关。因此使用本发明对患者的样本进行检测，可以协助医生为甲状腺癌患者选择适合的靶向药物，提高甲状腺癌治疗效果，无疑具有非常重要的临床价值和巨大的经济效益。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域，具体涉及一种检测甲状腺癌靶向用药相关基因变异的引物及试剂盒。

背景技术

甲状腺癌是内分泌系统常见的恶性肿瘤。据中国肿瘤登记中心的数据显示，我国城市地区女性甲状腺癌发病率居女性所有恶性肿瘤的第4位。甲状腺癌分为分化型甲状腺癌（differentiated thyroid cancer，DTC）、髓样甲状腺癌（medullary thyroid cancer，MTC）和未分化甲状腺癌（anaplastic thyroid cancer，ATC）。各种类型的甲状腺癌恶性程度不同，治疗方式和预后也大相径庭。

靶向治疗是放射性碘抵抗或手术不能切除的甲状腺癌患者的重要治疗方式。索拉非尼（sorafenib）是一种同时靶向VEGFRs、RET/PTC及BRAF基因的小分子酪氨酸激酶抑制剂（tyrosine kinase inhibitors, TKI）。2013 年，美国食品药物管理局（Food and DrugAdministration, FDA）批准索拉非尼用于治疗局部复发或转移、放射性碘抵抗的进展期DTC。凡德他尼（vandetanib）是口服的小分子TKI，可同时作用于VEGFR-1、VEGFR-2 和 RET基因等多靶点，2011年成为首个被FDA批准的治疗症状性或进展性MTC靶向药物。卡博替尼（cabozantinib）是另一种口服小分子多靶点治疗药物，可同时作用 VEGFR-1、VEGFR-2、MET和RET基因，2012年被FDA批准为第二种治疗进展期转移性MTC的靶向药物，对于治疗进展期、不能切除或转移性MTC具有很大的帮助。2018年，针对NTRK1-3基因融合的靶向药物拉罗替尼（LOXO-101）被批准上市，拉罗替尼是 FDA 批准的首个针对特定基因变异、跨越肿瘤部位的广谱抗癌药。另外，针对RET基因融合和突变的靶向药物塞尔帕替尼（LOXO-292）被FDA批准用于进展期及远端转移的且携带RET基因融合或突变的甲状腺癌。多个甲状腺癌诊疗指南和专家共识均指出：靶向治疗是难治性或晚期甲状腺癌的重要治疗方式，能减轻患者的症状并延长生存期，推荐进行基因检测筛选靶点，指导靶向药物的选择。

因此，我们发明了一种检测甲状腺癌靶向用药相关基因变异的引物及试剂盒，通过对一组甲状腺癌靶向用药相关的基因变异进行检测，其检测结果可以用来协助医生为甲状腺癌患者选择适合的靶向药物进行治疗，可以提高甲状腺癌靶向药物选择的准确性，从而减轻患者的症状并延长生存期，无疑具有非常重要的临床使用价值。

发明内容

本发明的主要目的在于提供一种准确度高的用于检测甲状腺癌靶向用药相关基因变异的引物及试剂盒，为甲状腺癌靶向药物的选择提供良好的辅助作用。