[发明专利]一种利用MSH4基因中SV313分子标记区分大白猪和江口萝卜猪的检测技术

权利要求书

1.一种区分大白猪和江口萝卜猪的SV313分子标记，其特征在于：MSH4基因中SV313分子标记位于猪参考基因组Sscrofa11.1chr6:137499097-137499409，共313bp，存在缺失或不缺失情况，将该SV区间的等位基因定义为I和D，对应II、ID和DD三种基因型，其中II为正常基因型、DD为纯合缺失基因型、ID为杂合型。

2.根据权利要求1所述的区分大白猪和江口萝卜猪的SV313分子标记，其特征在于：SV313的一组引物，所述的引物分别为：上游引物MSH4-F1：5’-AAAGTAGTACCAGCAGAACCTAGATAGAT-3’，下游引物MSH4-R1：5’-GAGGTAGAAAAGGTGACGAGACAG-3’，能特异性扩增出1183bp和870bp两种条带，对应的目的序列分别为SEQ ID No.1和SEQID No.2，SEQ ID No.3为两者之间的差异序列。

3.如权利要求1-2之一所述的SV313分子标记的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：(1)提取待测大白猪和江口萝卜猪的基因组DNA；(2)以这两个待测猪种的基因组DNA为模板，分别利用特异性引物MSH4-F1和MSH4-R1，进行PCR检测，分析样品中SV313的基因型；(3)用1.0％含核酸染料的琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物，凝胶成像系统观察记录条带并判断各样品基因型。

4.根据权利要求3所述的检测方法，其特征在于：步骤(2)中进行PCR所使用的扩增体系为20μL，即：

进行PCR采用的反应条件：

5.一种利用权利要求1-2之一所述的SV313分子标记区分大白猪和江口萝卜猪的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：(1)采用PCR技术检测SV313在大白猪和江口萝卜猪中基因型分布情况，计算出等位基因频率；(2)应用SPSS v26.0中的卡方检验进行双侧检验，分析大白猪与江口萝卜猪该SV313区间等位基因分布频率是否有显著差异；(3)根据各群体中SV313的等位基因频率不同来区分大白猪和江口萝卜猪。