[发明专利]一种利用DGKK基因中SV119分子标记区分大白猪和香猪的检测技术在审
申请号: | 202011547777.1 | 申请日: | 2020-12-24 |
公开(公告)号: | CN112626230A | 公开(公告)日: | 2021-04-09 |
发明(设计)人: | 冉雪琴;黄世会;李大鹏;牛熙;王嘉福 | 申请(专利权)人: | 贵州大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 贵阳易博皓专利代理事务所(普通合伙) 52116 | 代理人: | 田常娟 |
地址: | 550025 贵州省*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 dgkk 基因 sv119 分子 标记 区分 大白 检测 技术 | ||
1.一种区分大白猪和香猪的SV119分子标记,其特征在于:分子标记SV119位于猪参考基因组Sscrofa 11.1chrX:4404870644048824,共119bp,包含在DGKK基因的第2内含子上,该区域存在缺失或不缺失两种类型,SV区间有I和D两种等位基因,II、ID和DD型三种基因型,其中II为正常基因型、DD为纯合缺失基因型、ID为杂合型。
2.根据权利要求1所述的一种区分大白猪和香猪的SV119分子标记,其特征在于:所述的SV119分子标记的一组引物,上游引物DGKK-F1:5’-CATTTATGCACTGAACAGAGGAGTAAC-3’,下游引物DGKK-R1:5’-CATTTCTTAGTCATTTAATTTGTTGGCA-3’,能特异性扩增出两种大小不一的目的条带,对应序列分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2,缺失区间序列为SEQ ID No.3。
3.如权利要求1或2之一所述的一种区分大白猪和香猪的SV119分子标记的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:(1)提取待测大白猪和香猪基因组DNA;(2)以2个待测猪种的基因组DNA为模板,分别利用上游引物DGKK-F1、下游引物DGKK-R1进行PCR扩增;(3)用3.0%含核酸染料的琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物,凝胶成像系统观察记录条带并判断待测样品SV119的基因型。
4.根据权利要求3所述的检测方法,其特征在于:所述的步骤(2)中进行PCR所使用的扩增体系为20μL,具体如下:
进行PCR采用的反应条件:
5.一种利用权利要求1或2所述的SV119分子标记区分大白猪和香猪的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:(1)采用普通PCR技术检测SV119在大白猪和香猪群体中的基因型分布情况;(2)应用SPSS v26.0中的卡方检验进行双侧检验,分析大白猪与香猪该SV119区间等位基因分布频率的差异;(3)根据群体中SV119的等位基因频率不同来区分大白猪和香猪。
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