[发明专利]一种检测靶核酸拷贝数重复的方法和试剂盒

权利要求书

1.一种检测待测样本的基因组中靶核酸拷贝数重复的方法，其包括以下步骤:

(a)提供含有来源于所述待测人样本的靶核酸的样品，所述靶核酸包含一种或多种候选SNP位点，并且，

提供通用引物，并且，针对每一种候选SNP位点，提供至少一个靶特异性引物对；其中，

所述通用引物包含第一通用序列；

所述靶特异性引物对能够以所述靶核酸为模板进行扩增，产生含有所述候选SNP位点的核酸产物，并且所述靶特异性引物对包含一个正向引物和一个反向引物，其中，所述正向引物包含第二通用序列和特异于所述靶核酸的正向核苷酸序列，且所述正向核苷酸序列位于第二通用序列的3'端；所述反向引物包含第一通用序列和特异于所述靶核酸的反向核苷酸序列，且所述反向核苷酸序列位于第一通用序列的3'端；并且，在允许核酸杂交或退火的条件下，所述第一通用序列能够与所述第二通用序列的互补序列杂交或退火，且所述第二通用序列与所述第一通用序列存在差异，所述差异包括位于第一通用序列3'端的一个或多个核苷酸各自独立地被缺失或置换；并且，所述第一通用序列不能与所述正向引物的互补序列完全互补；和

(b)在允许核酸扩增的条件下，使用所述通用引物以及所述靶特异性引物对，通过扩增样品中的靶核酸，从而获得扩增产物；

(c)对步骤(b)获得的扩增产物进行熔解曲线分析，并获得各SNP位点的基因型别；

(d)根据步骤(c)的熔解曲线分析结果，挑选至少一个(例如，1个，2个，3个，4个，5个，10个，15个，20个，或更多个)杂合的SNP位点作为目标SNP位点，在所述目标SNP位点上具有第一等位基因和第二等位基因；

(e)计算所述目标SNP位点的第一等位基因和第二等位基因对应的熔解峰峰高Rm的比值HR_待测，并计算所述HR_待测与参考值的比值NHR_待测；将所述比值NHR_待测与参考范围进行比较，从而判断待测样本的靶核酸拷贝数是否重复；其中，所述参考值为正常人在所述目标SNP位点的第一等位基因和第二等位基因对应的Rm的比值HR_对照的平均值，且所述参考范围为正常人基因组中所述目标SNP位点的归一化峰高比值NHR_对照的波动范围；

优选地，所述靶核酸为染色体(例如，常染色体)。