[发明专利]一种香菇L868菌株的InDel标记指纹图谱及其构建方法有效
申请号: | 202011567123.5 | 申请日: | 2020-12-25 |
公开(公告)号: | CN113215294B | 公开(公告)日: | 2023-03-24 |
发明(设计)人: | 于海龙;章炉军;沈秀芬;宋春艳;尚晓冬;谭琦;张美彦;张丹;李巧珍;李玉 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 上海容慧专利代理事务所(普通合伙) 31287 | 代理人: | 张竹梅 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 香菇 l868 菌株 indel 标记 指纹 图谱 及其 构建 方法 | ||
1.一种用于鉴定香菇L868菌种的方法,其特征在于利用如下7对InDel标记引物组合,对香菇菌种进行扩增,将得到的带型与L868菌种的带型对照,与该带型一致即为香菇L868菌种;其中香菇L868菌种的带型编号组合为:0/(1+2)/1/(1+2)/1/1/(1+2);其中引物Lefp_id001对应的编号是第一对带型0,其中0对应的是没有条带;引物Lefp_id002对应的编号是第二对带型(1+2),其中1对应的是236bp,2对应的是214bp;引物Lefp_id003对应的编号是第三对带型1,其中1对应的是265bp;引物Lefp_id004对应的编号是第四对带型(1+2),其中1对应的270bp,2对应的是232bp;引物Lefp_id005对应的编号是第五对带型1,其中1对应的是378bp;引物Lefp_id006对应的编号是第六对带型1,其中1对应的是277bp;引物Lefp_id007对应的编号是第七对带型(1+2),其中1对应的是284bp,2对应的是264bp;
7对InDel标记引物序列5′-3′如下:
Lefp_id001正向引物:ACGGATGGAGAGACACAGGA
反向引物:TGCCCCACTTACTCTCAACC
Lefp_id002正向引物:CCTTTCTCAAAAGCGGACTG
反向引物:GGGAGTGGGTTGTTTGGATA
Lefp_id003正向引物:CGGATGTTATGCACTGGAAG
反向引物:CGTACGGTTGGACATTTGAA
Lefp_id004正向引物:AGCCTTTCACAGTCAGCTCG
反向引物:GTCAACGGAGGGAAACAGAG
Lefp_id005正向引物:GTAGCACTCCTCATACAACC
反向引物:ACCAAATGTCACAGCACAGG
Lefp_id006正向引物:ACATTGGCGAAGGCTGTACG
反向引物:CCCTTTTGCCCTATAAGGCG
Lefp_id007正向引物:AACAGTAACCTGTGCACTGC
反向引物:CATGATCAGATCACACAGCG。
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