[发明专利]一种致病疫霉LFD-RPA检测引物和探针及其应用在审

专利信息
申请号: 202011582916.4 申请日: 2020-12-28
公开(公告)号: CN112575113A 公开(公告)日: 2021-03-30
发明(设计)人: 陈庆河;王荣波;赵玉梅;刘裴清;李本金;翁启勇 申请(专利权)人: 福建省农业科学院植物保护研究所;海南大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 代理人: 王敏
地址: 350013 福建*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 一种 致病 lfd rpa 检测 引物 探针 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种致病疫霉LFD-RPA检测引物和探针,其特征在于,引物和探针序列如下:

PiRPA-LFD-F:5’-TAACTGATACTAACCTCGTTCAACCTCGTA-3’,SEQ.ID.NO.1;

PiRPA-LFD-R:5’-CTCATTAATAAACTGATATCCGCAGGGTAAGG-3’,SEQ.ID.NO.2;

PiRPA-LFD-P:5’-GCTTCGATTCACGGACGACACGTTTGACGACACCTCCAGAGCACAA-3’SEQ.ID.NO.3;

所述PiRPA-LFD-R的5’端连接有Biotin;所述PiRPA-LFD-P的5’端连接有FAM荧光基团,第31位C和第32位A之间插入四氢呋喃分子,3’端连接有C3-spacer。

2.一种如权利要求1所述致病疫霉的LFD-RPA检测引物和探针的反应体系,其特征在于,具体如下:

反应体系为50μl:

3.如权利要求2所述的致病疫霉的LFD-RPA检测引物和探针的应体系,其特征在于,反应条件为:39℃温育5min,将反应管再次混匀,继续39℃温育25min。

4.一种利用权利要求1所述致病疫霉的LFD-RPA引物和探针快速鉴定致病疫霉的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)提取待检测样品基因组DNA;

(2)LFD-RPA检测反应体系:以步骤(1)提取的DNA为模板,利用引物PiRPA-LFD-F和PiRPA-LFD-R及探针PiRPA-LFD-P进行扩增;反应体系为50μl,包含29.5μl Rehydrationbuffer,10μM PiRPA-LFD-F和PiRPA-LFD-R各2.1μl,探针10μM PiRPA-LFD-P 0.6μl,待测模板DNA 2.0μl,无菌双蒸水11.2μl,将上述组分混匀后加入到50mg RPA冻干酶粉中,随后加入2.5μl280mM醋酸镁并颠倒混匀;在39℃温育5min,将反应管再次混匀,继续39℃温育25min;

(4)结果检测:采用侧流层析试纸条进行检测;取10μl步骤(3)的反应产物与100μlHybriDetect Assay Buffer混合,然后将试纸条样品段垂直插入混合液中,室温静置5min后观察结果;试纸出现两条紫红色条带,一条位于质控区内,一条位于检测区,则结果为阳性,表明样本中含有致病疫霉;当试纸条只有质控区出现一条紫红色条带,检测区没有条带,则结果是阴性,表明样本中不含有致病疫霉。

5.如权利要求1-4任一项所述的致病疫霉LFD-RPA检测引物和探针在制备致病疫霉菌分子检测试剂中的应用。

6.如权利要求1-4任一项所述的致病疫霉LFD-RPA检测引物和探针在制备致病疫霉菌RPA分子检测试剂中的应用。

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