[发明专利]一种用于DNA倍体分析的SVM细胞核分类器训练方法有效

专利信息
申请号: 202011588584.0 申请日: 2020-12-28
公开(公告)号: CN112766048B 公开(公告)日: 2023-04-07
发明(设计)人: 刘炳宪;谢菊元;王焱辉;王克惠;黄涛 申请(专利权)人: 宁波江丰生物信息技术有限公司
主分类号: G06V20/69 分类号: G06V20/69;G06V10/774;G06V10/764
代理公司: 上海申新律师事务所 31272 代理人: 俞涤炯
地址: 315400 浙江省宁*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 dna 分析 svm 细胞核 分类 训练 方法
【说明书】:

发明提供了一种用于DNA倍体分析的SVM细胞核分类器训练方法,包括:对细胞学的扫描图像进行预处理得到多个细胞核待选区一;去除每个细胞核待选区域一中的淋巴细胞以及杂质图像;于细胞核待选区域一中去除重叠的细胞核,得到由单个细胞核构成的多个细胞核待选区域二;分别提取每个细胞核待选区域二的多种形态特征、纹理特征和颜色特征以组成一个多维的特征,多维的特征用以作为最终的细胞核待选区域三;采用SVM分类器对细胞核待选区域三进行分类训练,其中,分类结果包括粒细胞和体细胞。其技术方案的有益效果在于,能有效地在分类前过滤大量淋巴细胞、杂质和重叠细胞,使用较少的特征主要对体细胞和粒细胞进行分类,提高了分类器训练的效率。

技术领域

本发明涉及通信技术领域,尤其涉及一种用于DNA倍体分析的SVM细胞核分类器训练方法。

背景技术

细胞学检查作为宫颈癌、口腔癌等早期癌症筛查的主要途径,需要经验丰富的病理医生在显微镜下对细胞核形态、颜色等进行分析给出结论,这种方法存在效率低、可重复性差且容易受主观性影响。而DNA倍体分析技术通过估计细胞核DNA的含量自动给出结果,相较而言,敏感性高、客观并且可重复性强,这项技术有效解决了医生经验不足的问题,也提高了筛查效率。但是DNA倍体分析需要对细胞核进行分类,主要对体细胞进行分析,而现有基于SVM或GDBT的细胞核分类器通常会按体细胞、粒细胞、淋巴细胞、杂质样本做四分类分类器,采用大量(80维甚至更高)基于形态、颜色和纹理等特征进行训练。但由于杂质形态、颜色多样因此通常难以准确分离,这影响了分类器的训练效率和分类结果。

发明内容

针对现有技术中的SVM细胞核分类器训练方法存在的上述问题,现提供一种旨在提高SVM细胞核分类器的训练效率的训练方法。

具体技术方案如下:

一种用于DNA倍体分析的SVM细胞核分类器训练方法,其中,包括以下步骤:

S1、对细胞学的扫描图像进行预处理得到多个细胞核待选区一;

S2、去除每个所述细胞核待选区域一中的淋巴细胞以及杂质图像;

S3、于所述细胞核待选区域一中去除重叠的细胞核,得到由单个细胞核构成的多个细胞核待选区域二;

S4、分别提取每个所述细胞核待选区域二的多种形态特征、纹理特征和颜色特征以组成一个多维的特征,所述多维的特征用以作为最终的细胞核待选区域三;

S5、采用SVM分类器对所述细胞核待选区域三进行分类训练,其中,分类结果包括粒细胞和体细胞。

优选的,在所述S1中,包括以下步骤:

S11、对所述扫描图像进行双边滤波以及均值滤波处理;

S12、采用颜色反卷积的方法得到细胞核区域部分;

S13、对所述细胞核区域部分采用最大值稳定区域处理得到局部区域;

S14、对所述局部区域基于轮廓信息进行区域二值化处理。

优选的,在所述步骤S2中,通过采用预设面积阈值的方法去除淋巴细胞。

优选的,在所述步骤S2中,杂质图像中蓝色通道像素值较小,去除杂质图像的方法,如下式所示:

Bmin=min(IB*Imask);

其中,IB为蓝色通道图像,Imask为细胞核掩膜。

优选的,在所述步骤S3中,去除重叠的细胞核的方法包括,设置连通域的有效阈值进行滤波处理,过滤后的连通域个数若不为零,则判定当前的细胞核为重叠细胞核,予以过滤处理。

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