[发明专利]辅助诊断肺癌的基因组合及其应用在审
申请号: | 202011589148.5 | 申请日: | 2020-12-29 |
公开(公告)号: | CN112802551A | 公开(公告)日: | 2021-05-14 |
发明(设计)人: | 杨承刚;宋宏涛 | 申请(专利权)人: | 北京泱深生物信息技术有限公司 |
主分类号: | G16B25/00 | 分类号: | G16B25/00;G16B25/20;G16B40/00;C12Q1/6886;C12N15/11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 辅助 诊断 肺癌 基因 组合 及其 应用 | ||
本发明公开了用于辅助诊断肺癌的基因组合及其应用。本发明的基因组合及其引物能够用于诊断试剂盒,用于肺癌的诊断,该试剂盒灵敏度高。
技术领域
本发明涉及疾病诊断领域,更具体地,本发明涉及辅助诊断肺癌的基因组合 及其应用。
背景技术
目前针对肺癌尚无有效的治疗手段。早期肺癌患者可通过手术治疗达到较 好的预后,因此肺癌的早发现早预防早治疗,防止疾病进展,避免临床失代偿 性并发症的出现是肺癌治疗的基本原则。由于肺具有较强的代偿性,早期肺癌 往往并不表现出明显的临床症状,而到了症状较明显时,往往已到了肺癌晚 期。因此发现肺癌的诊断标志物具有良好的临床意义及应用价值。
临床上用于确诊肺癌的手段主要依靠超声影像并由肺穿刺进行确诊。超声诊 断的灵敏度较低,而肺穿刺对患者的肺部有损伤,存在风险,不易推广,导致很 多患者直到肺癌失代偿期才被确诊。最近有研究发现基因分子可以作为肺癌诊断 的标志物,但是单个基因诊断的敏感度与特异性有待提高。
发明内容
本发明提供了一种诊断肺癌或预测肺癌预后的系统,该系统包括用于输入分 子标志物的表达量的输入装置、用于输出肺癌诊断结果或预测肺癌预后结果的输 出装置;其中所述分子标志物为IGFBP3、MFAP5、SIX1、TCN1。
进一步,所述系统还包括计算装置,所述计算装置包括存储器和处理器;所 述存储器中存储有计算机程序,所述处理器被配置为执行所述存储器中存储的计 算机程序;计算装置用于根据所述标志物的表达量,分析出肺癌风险结果的可能 性或预测出肺癌患者预后情况。
例如,所述计算机程序运行以下公式:riskScore=(0.085689*IGFBP3基因 mRNA表达水平)+(-0.11601*SIX1基因mRNA表达水平)+(0.042055* MFAP5基因mRNA表达水平)+(0.057803*TCN1基因mRNA表达水平)。所述计算 装置以riskScore的中位数为阈值,高于该阈值,判断肺癌患者预后差;低于该阈 值,判断肺癌患者预后良好。
进一步,该系统还包括分子标志物的表达量的检测装置;优选地,所述检测 装置包括实时定量PCR仪和实时定量PCR引物、高通量测序平台、检测芯片和 芯片信号读取器。
进一步,所述芯片包括检测标志物表达量的探针;优选地,所述芯片还包括 内参探针,所述内参探针为检测GAPDH或β-Actin的表达量的探针。
进一步,实时定量PCR引物包括检测分子标志物表达量的实时定量PCR引 物;优选地,实时定量PCR引物还包括内参引物,所述内参引物为检测GAPDH 或β-Actin的实时定量PCR引物。
本发明还提供了检测分子标志物的试剂在制备用于诊断肺癌或预测肺癌预 后的产品中的用途,其中,所述分子标志物为IGFBP3、MFAP5、SIX1、TCN1。
进一步,所述试剂包括能够结合所述分子标志物的核酸;所述核酸能够检测 所述分子标志物的表达水平。
更进一步,所述核酸包括实时定量PCR中使用的特异扩增所述分子标志物的 引物。
更进一步,所述核酸包括基因芯片中使用的针对所述分子标志物的探针。
进一步,检测分子标志物是通过以下步骤进行的:
1)获得受试者样本;
2)确定所述样本中所述分子标志物的表达量。
本发明还提供了一种用于诊断肺癌或预测肺癌预后的产品,所述产品包括检 测分子标志物表达量的试剂,所述分子标志物为IGFBP3、MFAP5、SIX1、TCN1。
进一步,所述产品包括芯片、试剂盒、试纸或高通量测序平台。
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