[发明专利]与肺癌相关的基因标志物及其应用

说明书

本发明公开了与肺癌相关的基因标志物及其应用。本发明的标志物包括PMAIP1、BMP5、GPR87、MFAP5。本发明的研究成果为早期肺癌筛查提供了一种新的方式，且检测的准确度和灵敏度优于单个肿瘤标志物检测。

技术领域

本发明涉及疾病诊断领域，更具体地，本发明涉及与肺癌相关的基因标志物及其应用。

背景技术

肺癌是中国以及全球发病率最高的恶性肿瘤，也是导致男性癌症死亡的首要原因。在女性人群中肺癌的发生率仅次于乳腺癌。全球疾病负担(Global Burden ofDisease,GBD)数据显示，2016年全球患有气管、支气管或肺癌的人数超过280万，其中中国患病人数高达100万。2016年全球患有上述癌症的死亡人数为170万，占总死亡人数的3.12％。中国2016年死亡患者数为59万，占总死亡人数的6.11％。统计结果显示，从1990年到2016年全球气管、支气管和肺癌患病率和死亡率持续增长，中国患病率和死亡率也持续增长且增长趋势和全球增长趋势相对一致。

中国云南是癌症高发区之一，特别是女性肺癌发病率是世界上最高的地区之一。云南省肺癌平均发病率为44人/10万人，是全国平均发病率的两倍。其中，云南省宣威地区肺癌发病率位居全国第一。宣威肺癌的发病机制尚不清楚。从近几年统计来看，宣威、富源等以采矿业较为集中的地区发病率较高，因此临床上不排除环境污染与肺癌的关系。目前针对肺癌尚无有效的治疗手段。早期肺癌患者可通过手术治疗达到较好的预后，因此肺癌的早发现早预防早治疗，防止疾病进展，避免临床失代偿性并发症的出现是肺癌治疗的基本原则。由于肺具有较强的代偿性，早期肺癌往往并不表现出明显的临床症状，而到了症状较明显时，往往已到了肺癌晚期。因此发现肺癌的诊断标志物具有良好的临床意义及应用价值。

临床上用于确诊肺癌的手段主要依靠超声影像并由肺穿刺进行确诊。超声诊断的灵敏度较低，而肺穿刺对患者的肺部有损伤，存在风险，不易推广，导致很多患者直到肺癌失代偿期才被确诊。最近有研究发现基因分子可以作为肺癌诊断的标志物，但是单个基因诊断的敏感度与特异性有待提高。

发明内容

本发明提供了一种诊断肺癌或预测肺癌预后的系统，该系统包括用于输入分子标志物的表达量的输入装置、用于输出肺癌诊断结果或预测肺癌预后结果的输出装置；其中所述分子标志物为PMAIP1、BMP5、GPR87、MFAP5。

进一步，所述系统还包括计算装置，所述计算装置包括存储器和处理器；所述存储器中存储有计算机程序，所述处理器被配置为执行所述存储器中存储的计算机程序；计算装置用于根据所述标志物的表达量，分析出肺癌风险结果的可能性或预测出肺癌患者预后情况。

例如，所述计算机程序运行以下公式：riskScore＝(0.053256*PMAIP1基因mRNA表达水平)+(0.022275*MFAP5基因mRNA表达水平)+(-0.12733*BMP5基因mRNA表达水平)+(0.026497*GPR87基因mRNA表达水平)。所述计算装置以riskScore的中位数为阈值，高于该阈值，判断肺癌患者预后差；低于该阈值，判断肺癌患者预后良好。

进一步，该系统还包括分子标志物的表达量的检测装置；优选地，所述检测装置包括实时定量PCR仪和实时定量PCR引物、高通量测序平台、检测芯片和芯片信号读取器。

进一步，所述芯片包括检测标志物表达量的探针；优选地，所述芯片还包括内参探针，所述内参探针为检测GAPDH或β-Actin的表达量的探针。

进一步，实时定量PCR引物包括检测分子标志物表达量的实时定量PCR引物；优选地，实时定量PCR引物还包括内参引物，所述内参引物为检测GAPDH或β-Actin的实时定量PCR引物。

本发明还提供了检测分子标志物的试剂在制备用于诊断肺癌或预测肺癌预后的产品中的用途，其中，所述分子标志物为PMAIP1、BMP5、GPR87、MFAP5。