[发明专利]一种生物状态表征方法、装置、设备及存储介质

权利要求书

1.一种生物状态表征方法，其特征在于，所述方法包括：

根据待测试基因列表和预设基准基因列表，确定差异表达基因集；

从预设的基因组数据库中，获取基因网络，所述基因网络包括：多个通路网络，每个通路网络中包括至少两个基因之间的关联通路；

根据所述差异表达基因集中各差异表达基因在每个通路网络中的连接关系，确定所述每个通路网络对应的通路指纹得分；

根据所述每个通路网络对应的通路指纹得分，确定目标通路网络；

确定所述目标通路网络上的差异表达基因为基因标志物，所述基因标志物用于指示存在疾病风险的基因。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述每个基因网络用于表征一种疾病的不同诱发原因；所述方法还包括：

将所述每个通路网络对应的通路指纹得分输入预先训练的基因分析模型，得到所述待测试基因列表存在疾病的风险值；其中，所述基因分析模型为根据样本基因列表对应的每个通路网络的通路指纹得分进行训练得到的模型。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：

根据所述每个通路网络中差异表达基因的数量，得到所述每个通路网络对应的基础得分；

根据所述基础得分和所述通路指纹得分，得到所述每个通路网络的目标通路指纹得分；

所述根据所述每个通路网络对应的通路指纹得分，确定目标通路网络，包括：

根据所述每个通路网络对应的目标通路指纹得分，确定目标通路网络。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述连接关系包括直接连接关系以及间接连接关系，所述直接连接关系的基因得分大于所述间接连接关系的基因得分；

所述根据所述差异表达基因集中各差异表达基因在每个通路网络中的连接关系，确定所述每个通路网络对应的通路指纹得分，包括：

根据所述差异表达基因集中各差异表达基因在每个通路网络中的直接连接关系，确定所述每个通路网络中具有直接连接关系的基因得分；

根据所述差异表达基因集中各差异表达基因在每个通路网络中的间接连接关系，确定所述每个通路网络中具有间接连接关系的基因得分；

根据所述每个通路网络中具有直接连接关系的基因得分以及所述每个通路网络具有间接连接关系的基因得分，确定所述每个通路网络对应的通路指纹得分。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据待测试基因列表和预设基准基因列表，确定差异表达基因集，包括：

采用高通量测序技术，获取所述待测试基因列表以及所述预设基准基因列表分别对应的基因表达谱；

根据所述待测试基因列表以及所述预设基准基因列表分别对应的基因表达谱中各基因对应的基因表达量，得到差异表达基因集。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述根据所述每个通路网络对应的通路指纹得分，确定目标通路网络，包括：

根据所述每个通路网络对应的通路指纹得分以及预先设置的通路指纹得分阈值，确定目标通路网络。

7.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：

展示所述每个通路网络对应的通路指纹得分的得分表，所述得分表中显示有：所述每个通路网络的名称以及所述每个通路网络的通路指纹得分。

8.一种生物状态表征装置，其特征在于，所述装置包括：

第一确定模块，用于根据待测试基因列表和预设基准基因列表，确定差异表达基因集；

获取模块，用于从预设的基因组数据库中，获取基因网络，所述基因网络包括：多个通路网络，每个通路网络中包括至少两个基因之间的关联通路；

第二确定模块，用于根据所述差异表达基因集中各差异表达基因在每个通路网络中的连接关系，确定所述每个通路网络对应的通路指纹得分；

第三确定模块，用于根据所述每个通路网络对应的通路指纹得分，确定目标通路网络；

第四确定模块，用于确定所述目标通路网络上的差异表达基因为基因标志物，所述基因标志物用于指示存在疾病风险的基因。