[发明专利]一种水稻硝酸盐转运蛋白基因NRT1.1B的SNP分子标记及其应用在审

专利信息
申请号: 202011601159.0 申请日: 2020-12-29
公开(公告)号: CN112695119A 公开(公告)日: 2021-04-23
发明(设计)人: 彭佩;易丽媛;李宙炜;唐顺学;肖金华;田冰川 申请(专利权)人: 华智生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 肖云
地址: 410000 湖*** 国省代码: 湖南;43
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摘要:
搜索关键词: 一种 水稻 硝酸盐 转运 蛋白 基因 nrt1 snp 分子 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种水稻硝酸盐转运蛋白基因NRT1.1B的SNP分子标记,其特征在于:所述SNP分子标记为OS900201_K01,其中,OS900201_K01的多态性为A或G。

2.如权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于:所述SNP分子标记OS900201_K01的多态性位点位于Chr1.21759092。

3.一种用于检测如权利要求1所述的SNP分子标记OS900201_K01的引物组,其特征在于:所述引物组包括特异性引物和通用引物,其中,所述特异性引物包括Primer SeqAllele X和Primer Seq Allele Y,所述Primer Seq Allele X的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示;所述Primer Seq Allele Y的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述通用引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

4.如权利要求3所述引物组在水稻育种中的应用。

5.一种如权利要求1所述的SNP分子标记的检测方法,其特征在于:所述检测方法包括以下步骤:

S1、从水稻材料中提取基因组DNA;

S2、以步骤S1中提取的基因组DNA为模板,利用如权利要求3所述的引物组,对OS900201_K01分子标记进行检测;

S3、若OS900201_K01的SNP位点碱基为A,判定测试的水稻样品含纯合的氮高效利用的NRT1.1B基因;若检测位点碱基为G,判定测试的水稻样品含有纯合的普通nrt1.1b基因;若检测位点同时检测到A、G,判断待测水稻含有杂合的氮高效利用的NRT1.1B基因。

6.如权利要求5所述的检测方法,其特征在于:步骤S2中,用KASP技术对SNP位点进行检测。

7.如权利要求1或2任一所述SNP分子标记在水稻育种中的应用。

8.如权利要求7所述的SNP分子标记的应用,其特征在于:所述应用为利用OS900201_K01分子标记进行检测,选择携带NRT1.1B基因的水稻品系进行后续育种。

9.一种试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括核苷酸序列如权利要求3所述的引物组。

10.一种基因芯片,其特征在于:所述基因芯片包括核苷酸序列如权利要求3所述的引物组。

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