[发明专利]小麦抗白粉病基因Pm13的诊断型分子标记及其应用有效

专利信息
申请号: 202011621060.7 申请日: 2020-12-31
公开(公告)号: CN113151530B 公开(公告)日: 2023-07-18
发明(设计)人: 李欢欢;刘文轩;裴少龙;卞翔;孙正好;付巧;门文强;田修斌;陈麒帆;王贝麟 申请(专利权)人: 河南农业大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6806;C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 北京鑫浩联德专利代理事务所(普通合伙) 11380 代理人: 常桂凤
地址: 450002 河*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 小麦 白粉病 基因 pm13 诊断 分子 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种小麦抗白粉病基因Pm13的诊断型分子标记,其特征在于:所述的诊断型分子标记为CL897-2和CL114525-1,分子标记CL897-2的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,分子标记CL114525-1的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示。

2.一种如权利要求1所述的小麦抗白粉病基因Pm13的诊断型分子标记的获得方法,其特征在于:以具有Pm13基因的小麦基因组DNA为模板,采用如SEQ ID NO:1和2所示的序列的引物对进行PCR扩增,其所获得的扩增序列为SEQ ID NO:5;采用如SEQ ID NO:3和4所示的序列的引物对进行PCR扩增,其所获得的扩增序列为SEQ ID NO:6。

3.一种检测小麦抗白粉病基因Pm13的诊断型分子标记的引物对,其特征在于,检测分子标记CL897-2引物对的核苷酸序列如下所示:

上游引物SEQ ID NO:1:5’- TGTGGACGAGATTAAGTGTT -3’,

下游引物SEQ ID NO:2:5’- AAATAGGCCGTAGGAAAGT -3’;

检测分子标记CL114525-1引物对的核苷酸序列如下所示:

上游引物SEQ ID NO:3:5’- TGACATGGTCTCTCTGGTC -3’,

下游引物SEQ ID NO:4:5’- TTTTCTGTGTGCCTTTAGC -3’。

4.如权利要求3所述的检测小麦抗白粉病基因Pm13的诊断型分子标记的引物对在小麦抗白粉病基因Pm13的分子标记辅助育种中的应用。

5.一种小麦抗白粉病基因Pm13的诊断型分子标记的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤1)、选取抗白粉病材料中国春-高大山羊草3Sl/3B二体代换系TA3575和感白粉病受体亲本中国春,在一心一叶期接种白粉菌,在接种白粉菌前和接种后12小时、24小时、48小时分别取叶片进行RNA-Seq转录组测序;

步骤2)、从转录组测序结果中发现基因CL897Contig3和基因CL114525Contig1在感白粉病受体亲本中国春接种白粉菌前和接种白粉菌后表达量均为0,但在抗白粉病材料中国春-高大山羊草3Sl/3B二体代换系TA3575中接种前后均有表达;基因CL897Contig3的核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示,基因CL114525 Contig1的核苷酸序列如SEQ ID NO:8所示;

步骤3)、基因CL897Contig3与CS Ref Seq v1.0进行序列比对,发现该基因序列与小麦染色体3BS上的一段序列具有73%的相似性,根据CL897Contig3序列与3BS序列比对结果设计分子标记CL897-2,所述分子标记CL897-2的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示;

步骤4)、基因CL114525Contig1与CS Ref Seq v1.0进行序列比对,发现该基因序列与小麦染色体3DS上的一段序列具有87%的相似性,根据CL114525Contig1序列与3DS序列比对结果设计分子标记CL114525-1,所述分子标记CL114525-1的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示;

步骤5)、利用分子标记CL897-2,分别对不含Pm13的中国春、含Pm13的中国春-高大山羊草3Sl/3B二体代换系TA3575以及含Pm13的中国春-高大山羊草T3SlS.3BS-3BL易位系R1B的基因组DNA进行PCR扩增,含Pm13的中国春-高大山羊草3Sl/3B二体代换系TA3575和中国春-高大山羊草T3SlS.3BS-3BL易位系R1B均能扩增出特异条带,但在不含Pm13的中国春中没有扩增出任何条带,表明CL897-2为鉴定抗白粉病基因Pm13的分子标记;

步骤6)、利用分子标记CL114525-1,分别对不含Pm13的中国春、含Pm13的中国春-高大山羊草3Sl/3B二体代换系TA3575以及含Pm13的中国春-高大山羊草T3SlS.3BS-3BL易位系R1B的基因组DNA进行PCR扩增,含Pm13的中国春-高大山羊草3Sl/3B二体代换系TA3575和中国春-高大山羊草T3SlS.3BS-3BL易位系R1B均能扩增出特异条带,但在不含Pm13的中国春中没有扩增出任何条带,表明CL114525-1为鉴定抗白粉病基因Pm13的分子标记;

步骤7)、利用分子标记CL897-2和CL114525-1在18个国内小麦品种、中国春以及携带Pm13基因的中国春-高大山羊草3Sl/3B二体代换系TA3575和中国春-高大山羊草T3SlS.3BS-3BL易位系R1B的基因组DNA中进行PCR扩增,验证分子标记CL897-2和CL114525-1的适用性;结果表明,只有在携带Pm13基因的中国春-高大山羊草3Sl/3B二体代换系TA3575和中国春-高大山羊草T3SlS.3BS-3BL易位系R1B中能够扩增出特异条带,而其它一组小麦品种均无任何扩增条带,表明CL897-2和CL114525-1能够对含有Pm13基因的材料进行检测,确定标记CL897-2和CL114525-1为Pm13基因的诊断型分子标记。

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