[发明专利]一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法、装置和存储介质在审
申请号: | 202011623703.1 | 申请日: | 2020-12-31 |
公开(公告)号: | CN112795632A | 公开(公告)日: | 2021-05-14 |
发明(设计)人: | 汤丽慧;辜清泉;郑晨晴;吴莉萍;杨旭 | 申请(专利权)人: | 深圳瑞奥康晨生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6883;G16B20/30;G16B20/50;G16B25/20 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 彭家恩;彭愿洁 |
地址: | 518008 广东省深圳市盐田区海山*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 药物 代谢 作用 基因 检测 方法 装置 存储 介质 | ||
1.一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,其特征在于,包括:
基因型区分步骤:根据待测样本中靶标基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型;
基因型解读步骤:对不同位点的SNP基因型进行解读,确定待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议;
报告生成步骤:根据SNP基因型解读结果生成报告,输出待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议中的至少一组。
2.根据权利要求1所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,其特征在于,所述基因型区分步骤中,根据待测样本中靶标基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型具体包括:
获取不同位点对应的PCR荧光信号,根据PCR荧光信号的类型确定位点的碱基类型,其中,PCR荧光信号和碱基类型为一一对应的关系;
根据每个位点的碱基类型确定每个位点的SNP基因型。
3.根据权利要求2所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,其特征在于,所述基因型区分步骤之前还包括样本检测步骤,所述样本检测步骤包括:
获取待测样本DNA,确定待测样本DNA的检测项目和检测位点;
采用检测项目和检测位点对应的qPCR引物和荧光探针对待测样本DNA的靶标基因进行qPCR扩增;
采集靶标基因扩增过程中产生的PCR荧光信号。
4.根据权利要求3所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,其特征在于,所述检测项目包括叶酸、高血脂用药、抗心绞痛药物、氯吡格雷、华法林中的至少一种。
5.根据权利要求3所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法,其特征在于,所述PCR荧光信号包括FAM荧光信号和VIC荧光信号。
6.一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测装置,其特征在于,包括:
基因型区分模块:用于根据待测样本中靶标基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型;
基因型解读模块:用于对不同位点的SNP基因型进行解读,确定待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议;
报告生成模块:用于根据SNP基因型解读结果生成报告,输出待测样本的SNP位点名称、靶标基因、参考碱基、突变碱基、表型信息以及不同表型对应的用药建议中的至少一组。
7.根据权利要求6所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测装置,其特征在于,所述基因型区分模块中,根据待测样本中靶标基因的PCR荧光信号区分不同位点的SNP基因型具体包括:
获取不同位点对应的PCR荧光信号,根据PCR荧光信号的类型确定位点的碱基类型,其中,PCR荧光信号和碱基类型为一一对应的关系;
根据每个位点的碱基类型确定每个位点的SNP基因型。
8.根据权利要求6所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测装置,所述装置还包括样本检测模块,所述样本检测模块用于:
获取待测样本DNA,确定待测样本DNA的检测项目和检测位点;
采用检测项目和检测位点对应的qPCR引物和荧光探针对待测样本DNA的靶标基因进行qPCR扩增;
采集靶标基因扩增过程中产生的PCR荧光信号;
优选地,所述检测项目包括叶酸、高血脂用药、抗心绞痛药物、氯吡格雷、华法林中的至少一种;
优选地,所述PCR荧光信号包括FAM荧光信号和VIC荧光信号。
9.一种药物代谢酶和药物作用靶点基因检测装置,其特征在于:所述装置包括存储器和处理器;
所述存储器,包括用于存储程序;
所述处理器,包括用于通过执行所述存储器存储的程序以实现权利要求1-4任一项所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法。
10.一种计算机可读存储介质,其特征在于:所述存储介质中存储有程序,所述程序能够被处理器执行以实现权利要求1-4任一项所述的药物代谢酶和药物作用靶点基因检测方法。
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