[发明专利]一种控制小麦籽粒粒长的主效QTL位点及紧密连锁的KASP引物和应用有效
| 申请号： | 202011627384.1 | 申请日： | 2020-12-31 |
| 公开（公告）号： | CN112760399B | 公开（公告）日： | 2022-05-20 |
| 发明（设计）人： | 任天恒;范涛;李治;欧霞;谭飞泉 | 申请（专利权）人： | 四川农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人： | 戚星 |
| 地址： | 611130 四*** | 国省代码： | 四川;51 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 控制 小麦 籽粒 qtl 紧密 连锁 kasp 引物 应用 | ||
1.针对SNP分子标记AX-109894590的KASP引物，其特征在于，该KASP引物的正向引物1的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，其正向引物2的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，其反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；其中，所述正向引物1和正向引物2的5’端连接有不同的荧光标签序列。
2.一种鉴定小麦粒长主效QTL QKl.sau-6A的试剂盒，其特征在于，该试剂盒中的引物为权利要求1所述的KASP引物；所述主效QTL QKl.sau-6A在小麦的6A染色体上的遗传位置为16.78-31.64 cM。
3.一种鉴定小麦粒长主效QTL QKl.sau-6A的方法，其特征在于，该方法包含：
利用如权利要求1所述的KASP引物进行荧光定量PCR扩增，根据PCR扩增结果对待测小麦材料进行基因分型，为：
若待测小麦材料出现KASP引物的正向引物2的荧光探针的荧光信号，而不含有正向引物1的荧光探针的荧光信号，则该待测小麦材料含有所述的小麦粒长主效QTL QKl.sau-6A；
若待测小麦材料出现KASP引物的正向引物1的荧光探针的荧光信号，而不含有正向引物2的荧光探针的荧光信号，则该待测小麦材料不含所述的小麦粒长主效QTL QKl.sau-6A；
其中，所述主效QTL QKl.sau-6A在小麦的6A染色体上的遗传位置为16.78-31.64 cM；
所述小麦的品种为T1208或川农18。
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，含有所述的小麦粒长主效QTL QKl.sau-6A的待测小麦材料的基因型记为B基因型，不含所述的小麦粒长主效QTL QKl.sau-6A的待测小麦材料的基因型记为A基因型，所述B基因型小麦株系的籽粒粒长显著性高于A基因型小麦株系。
5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述荧光定量PCR扩增的反应体系包含：KASP Mastermix、如权利要求1所述的KASP引物、待测小麦材料的基因组DNA、RNase-free去离子水；其中，所述KASP引物中，正向引物1、正向引物2和反向引物的体积比为2:2:5。
6.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述荧光定量PCR扩增的反应程序包含：95℃预变性10min；95℃变性20s，61℃退火延伸40s，循环10次，每次循环退火延伸温度下降0.6℃；95℃变性20s，55℃退火延伸40s，循环30次；25℃保温，采集荧光信号。
7.如权利要求3所述的鉴定小麦粒长主效QTL QKl.sau-6A的方法的应用，其特征在于，该应用包含以下任意一种：
（1）在选育和创制不同籽粒粒长的小麦资源中的应用；
（2）在用于推广粒长主效QTL QKl.sau-6A与小麦的其它优良性状位点间聚合育种的应用。
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