[发明专利]一种高通量检测和判定幽门螺旋杆菌耐药性的方法

权利要求书

1.一种高通量检测和判定幽门螺旋杆菌耐药性的方法，其特征在于，包括以下步骤：

S1、石蜡标本和新鲜胃镜活检核酸提取

S11确认病人受检前停止服用抗生素一个月以上，质子泵抑制剂二周以上，中药二周以上，且经尿素呼气试验验证为阳性；

S12、确认采样的胃黏膜组织标本新鲜无污染，无食物残渣遗留；

S13在胃镜活检取样时尽量取胃窦与胃体病变部位双份样本，各两块，共四块标本分别放入一个运送培养基试管内，并确认组织样本浸入运送培养基的液体中，拧紧试管盖，48小时内2-8度冷藏运输；另外两块送病理科制作石蜡切块样本；

S2、核酸提取

对石蜡样本或新鲜活检样本采用试剂盒进行核算提取；

S3、靶基因扩增与测序

采用SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.22的正向引物和SEQ ID NO.23-SEQ ID NO.44的引物对进行靶基因扩增；

S4、耐药位点分析和判读

突变筛选标准为至少5条序列，正向反向至少有1条序列支持相应的突变，最终相关突变信息与耐药信息列表进行对照进行判读。

2.如权利要求1所述的高通量检测和判定幽门螺旋杆菌耐药性的方法，其特征在于，S1中初治患者的幽门螺旋杆菌采样采集千胃窦距幽门2-5cm处，补救治疗患者加采胃体和胃底处样本。

3.如权利要求1所述的高通量检测和判定幽门螺旋杆菌耐药性的方法，其特征在于，S1中多次根除治疗失败的患者，建议距上次治疗结束至少3个月。

4.如权利要求1所述的高通量检测和判定幽门螺旋杆菌耐药性的方法，其特征在于，S4中采用Ion Torrent测序数据质量控制，序列比对使用Ion iReporter。

5.如权利要求1所述的高通量检测和判定幽门螺旋杆菌耐药性的方法，其特征在于，S3中使用Ion AmpliSeq^TMLibrary Kit Plus构建测序文库，进行靶基因测序。