[发明专利]一种降低脱靶效应的RNA基因编辑系统的制备方法有效

专利信息
申请号: 202011635660.9 申请日: 2020-12-31
公开(公告)号: CN112778425B 公开(公告)日: 2022-11-18
发明(设计)人: 马旭;王译晗;高建恩 申请(专利权)人: 国家卫生健康委科学技术研究所
主分类号: C07K19/00 分类号: C07K19/00;C12N15/62;C12N9/06;C12N9/22;C12N9/78;C12N15/85
代理公司: 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 11250 代理人: 秦广成
地址: 100000 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 降低 脱靶 效应 rna 基因 编辑 系统 制备 方法
【权利要求书】:

1.一种融合蛋白,其特征在于,自N端至C端依次包括Cas13b蛋白的氨基酸序列、ADAR2蛋白的氨基酸序列和具有二氢叶酸还原酶活性的氨基酸序列。

2.根据权利要求1所述的融合蛋白,其特征在于,编码具有二氢叶酸还原酶活性的氨基酸序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.1中第6149位-6619位。

3.根据权利要求1或2所述的融合蛋白,其特征在于,还包括报告基团蛋白氨基酸序列;

可选的,所述融合蛋白,自N端至C端依次包括Cas13b蛋白的氨基酸序列、ADAR2蛋白的氨基酸序列、报告基团蛋白氨基酸序列和具有二氢叶酸还原酶活性的氨基酸序列;

可选的,所述报告基团蛋白为mCherry蛋白;

可选的,所述融合蛋白还包括NES氨基酸序列;

可选的,所述融合蛋白,自N端至C端依次包括Cas13b蛋白的氨基酸序列、NES氨基酸序列、ADAR2蛋白的氨基酸序列、报告基团蛋白氨基酸序列和具有二氢叶酸还原酶活性的氨基酸序列。

4.生物材料,其特征在于,包括如下任意一种:

1)编码权利要求1-3任一项所述的融合蛋白的核酸分子;可选的,所述核酸分子为DNA或RNA;可选的,所述DNA包括DNA分子、cDNA、基因组DNA或重组DNA;可选的,所述RNA为mRNA或hnRNA;可选的,如SEQ ID NO.1所示的第926位-6619位的DNA分子或cDNA;

2)表达权利要求1-3任一项所述的融合蛋白的表达盒、重组载体、重组微生物或转基因细胞系;

3)含1)所述的核酸分子的表达盒、重组载体、重组微生物或转基因细胞系;

4)含2)或3)中所述的表达盒的重组载体、重组微生物或转基因细胞系;

5)含2)或3)或4)中所述的重组载体的重组微生物或转基因细胞系。

5.权利要求1-3任一项所述的融合蛋白或权利要求4所述的生物材料在基因编辑或制备基因编辑工具中的用途;

可选的,所述基因编辑为RNA基因编辑;

可选的,在提高RNA基因编辑安全性中的用途;

可选的,在降低RNA基因编辑中脱靶效应的用途;

可选的,所述RNA基因编辑为RNA单碱基基因编辑;

可选的,所述RNA基因编辑为真核生物RNA单碱基基因编辑;

可选的,所述真核生物包括真核细胞。

6.一种RNA基因编辑系统,其特征在于,包括权利要求1-3任一项所述的融合蛋白;

可选的,所述RNA基因编辑系统为表达权利要求1-3任一项所述的融合蛋白的重组载体、重组微生物或转基因细胞系;

可选的,还包括sgRNA;

可选的,还包括sgRNA的表达载体。

7.一种如权利要求6所述的RNA基因编辑系统的制备方法,其特征在于,包括:

编码具有二氢叶酸还原酶活性的氨基酸序列的核苷酸序列记为ecDHFR DD核酸序列;将ecDHFR DD核酸序列构建到含有RNA基因编辑系统表达元件dRanCas13b与hADAR2的表达载体中,且ecDHFR DD核酸序列与表达元件dRanCas13b与hADAR2位于同一表达盒内,所述ecDHFR DD核酸序列位于hADAR2的C端,构建得到的表达载体记为ecRESCUE表达载体。

8.根据权利要求7所述的制备方法,其特征在于,所述含有RNA基因编辑系统表达元件dRanCas13b与hADAR2的表达载体为RESCUE RNA编辑系统的表达载体;

可选的,所述的RESCUE RNA编辑系统的表达载体为真核表达载体;

可选的,所述含有dRanCas13b与hADAR2表达元件的表达载体为在dRanCas13b的C端连有NES序列的载体;

可选的,所述NES序列的C端连有报告基团的核酸序列;

可选的,报告基团的核酸序列为mCherry的核酸序列;

可选的,报告基团的核酸序列的C端连有ecDHFR DD核酸序列。

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