[发明专利]新冠病毒感染血浆中特异性miRNA鉴定及其应用

说明书

本发明涉及新冠病毒感染血浆中特异性miRNA鉴定及其应用，鉴定了显著的miRNA来区分COVID‑19疾病的不同严重程度，例如COV和HC的has‑miR‑302a‑3p，SM和AS的miR‑122‑5p，SD和MD的hsa‑miR‑214‑3p_L+1R‑4。LTNP和STNP组的hsa‑miR‑95‑3p_R‑1和hsa‑miR‑429可预测和区分病人新冠病毒感染病情长短。本发明的生物标志物可以监测不同感染阶段，如感染初期和恢复期miRNA的差异表达水平，以反映患者病情的进展情况，有助于预测疾病的预后，并区分治疗策略，本发明的特异性miRNA用于在新冠肺炎的诊断、形成新冠肺炎的风险的预测或新冠肺炎的结果的预测。

技术领域

本发明属于新型冠状病毒肺炎的诊断领域，特别涉及新冠病毒感染血浆中特异性miRNA鉴定及其应用。

背景技术

新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019，COVID-19)，简称“新冠肺炎”，是由2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2病毒)引起的。据报道，SARS-CoV-2不断进化变异，可能与人类持续存在很久，因此探索诊断标记和药物治疗的靶标来治疗COVID-19十分迫切。成熟的microRNA是广泛分布于生物体和病毒中，一类内源表达进化保守的非编码单链小RNA分子，长度约为18至28个核苷酸。已知病毒感染和免疫反应密切相关，microRNA为免疫系统和免疫反应中的一般调节机制，但是宿主或病毒编码的microRNA分别与病毒或宿主mRNA相互作用的具体机制还不清楚。因此，特异性miRNA的发现和验证对于改进COVID-19的感染诊断和临床监测至关重要。

发明内容

本发明涉及一种分类新冠肺炎或者有风险形成新冠肺炎的患者的样品的方法，所述样品选自血液样品、血清样品或血浆样品中的一种或多种，所述方法包括如下步骤：

a)确定所述样品中选自如下至少一组中的至少一种miRNA的表达水平的步骤，

其中，COV和HC比较组包括：hsa-miR-370-3p、hsa-mir-12136-p3_1ss 19TC、hsa-miR-302b-3p_R-2、hsa-miR-302a-3p、hsa-miR-939-5p_R+1、hsa-miR-2020_010-5p；SM和AS比较组包括：hsa-miR-122-5p_R-1、hsa-miR-1246_R+1、hsa-miR-885-5p；AS和HC比较组包括：hsa-miR-2020_013-5p、hsa-miR-2020_005-3p、hsa-miR-2020_002-5p、hsa-miR-2020_017-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-145-5p、hsa-miR-23a-5p、hsa-miR-3960_R-2_1ss12AC、hsa-miR-146a-3p_L+2R-2、hsa-miR-1-3p、hsa-miR-133a-3p_R+1；SD和AS比较组包括：hsa-miR-92b-5p_R+1；MD和AS比较组包括：hsa-miR-193b-5p_R-1；MD和MD-R比较组包括hsa-miR-7977_1ss6AG，SD和SD-R比较组包括：hsamiR-625-5p；LTNP和STNP比较组包括：hsa-miR-95-3p_R-1、hsa-miR-429；SD和MD比较组包括：hsa-miR-214-3p_L+1R-4；

b)比较步骤a)中确定的表达水平的表达量与一种或几种参照表达水平的表达量；

c)从步骤b)中比较的结果将所述患者的样品分类为至少两类之一。

缩略词含义：SM是指，有新冠肺炎症状感染；AS是指，无新冠肺炎症状感染；SD是指，有新冠肺炎症状感染的重型和危重型；MD是指，有新冠肺炎症状感染轻型和普通型；SD-R是指，SD重复样本；MD-R是指，MD重复样本；LTNP是指，长期核酸检测(SARS-CoV-2)阳性样本(≥60天)；STNP是指，短期核酸检测SARS-CoV-2阳性样本(≤45天)；HC是指，健康对照组(Healthy Controls)、COV是指，新冠肺炎患者或试验组。