[实用新型]用于分析乳腺癌患者中的基因表达的盒

说明书

本申请涉及一种用于分析乳腺癌患者中的基因表达的盒，其包括附接有用于RT‑PCR扩增包括SURV(BIRC5)、CCNB1、MYBL2、BAG1、ESR1、PGR、BCL2、MMP11(STMY3)、GRB7和HER2(ERBB2)中的每一种的一组基因和至少一种参考基因的RNA转录物的引物的孔，并且其中所述盒被配置用于对每种所述RNA转录物执行RT‑PCR扩增。

技术领域

本申请涉及一种用于分析乳腺癌患者样品中的基因表达的系统以及所述系统的相关部件(包括包含用于扩增的引物的盒(cartridge))、包含试剂的组合物和试剂盒、以及相关操作方法。

背景技术

乳腺癌患者中某些基因的RNA表达与具有已知临床结果的总体乳腺癌患者群体中的表达水平相比的相对高水平或相对低水平，可以指示该患者与总体群体相比复发风险增加或减小。在一些情况下，高水平的RNA表达与高复发风险相关，而在其他情况下，低水平的RNA 表达与高复发风险相关。在一些情况下，高水平的RNA表达与低复发风险相关，而在其他情况下，低水平的RNA表达与低复发风险相关。用于预测复发风险的一些测试可利用乳腺癌患者中特定基因的 RNA表达水平与复发风险之间的此类关系，并且可以作为预测复发可能性的方式来评定多种基因的RNA表达水平。

发明内容

本公开包括例如用于分析乳腺癌患者中的特定基因的表达的系统，所述基因诸如其RNA表达水平可指示良好或较差临床结果的风险(诸如复发无存活的相对风险或总体存活的相对风险)的基因。例如，乳腺癌患者中某些基因的RNA表达与具有已知临床结果的总体乳腺癌患者群体中的表达水平相比的相对高水平或相对低水平，可以指示该患者与总体群体相比复发风险增加或减小。在一些情况下，高水平的RNA表达与高复发风险相关，而在其他情况下，低水平的RNA 表达与高复发风险相关。在一些情况下，高水平的RNA表达与低复发风险相关，而在其他情况下，低水平的RNA表达与低复发风险相关。用于预测复发风险的一些测试可利用乳腺癌患者中特定基因的 RNA表达水平与复发风险之间的此类关系，并且可以作为预测复发可能性的方式来评定多种基因的RNA表达水平。

本公开例如涵盖可用于对乳腺癌患者中的多种特定基因的RNA 表达水平进行此类分析的系统。本公开例如涵盖包括孔的盒，其中所述孔包含用于RT-PCR扩增一组潜在预后基因以及至少一种参考基因的RNA转录物的引物，所述参考基因诸如其表达预期不会因患者不同而改变的管家基因。引物可以附接至孔，例如使得引物的扩增可用于例如通过读取特定基因的扩增子(例如聚合酶链反应(PCR)产物) 在所述盒上的孔的限定空间内的水平来确定盒的结构内的RNA表达水平。因此，例如，引物可以定位或限定至盒内的特定孔。