[发明专利]用于处理或分析寡核苷酸编码分子的方法和系统在审

专利信息
申请号: 202080021046.5 申请日: 2020-03-13
公开(公告)号: CN113677836A 公开(公告)日: 2021-11-19
发明(设计)人: R·E·瓦茨;D·卡尼卡尔;P·J·麦克纳尼 申请(专利权)人: 海斯塔克科学公司
主分类号: C40B40/06 分类号: C40B40/06;C12Q1/6869
代理公司: 北京市铸成律师事务所 11313 代理人: 郗名悦;闫茂娟
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 用于 处理 分析 寡核苷酸 编码 分子 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种确定至少一种解析的寡核苷酸编码分子的靶活性的方法,包括:

提供分离介质,其中所述分离介质含有至少一种靶分子;

将含有至少两种不同的寡核苷酸编码分子的混合物的样品引入分离介质,其中所述至少两种不同的寡核苷酸编码分子包括与至少一个被编码部分可操作连接的编码部分;

通过将至少两种不同的寡核苷酸编码分子分离到分离介质中的至少两个分开的位置,形成至少两种不同的解析的寡核苷酸编码分子;

通过从所述分离介质分割至少两个分开的位置中的至少一个位置以形成至少一个解析的片段,从至少两种不同的解析的寡核苷酸编码分子中收获至少一种解析的寡核苷酸编码分子;

处理至少一种解析的寡核苷酸编码分子以允许进行聚合酶链式反应(PCR);

通过对至少一种解析的寡核苷酸编码分子的编码部分进行PCR来扩增所述至少一种解析的寡核苷酸编码分子的至少一个被编码部分;和

通过处理至少一种解析的寡核苷酸编码分子的至少一个被编码部分的至少一个位置和特征来确定至少一种解析的寡核苷酸编码分子的靶活性。

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述至少一种靶分子包括选自由下述组成的组中的至少一种:细胞、寡核苷酸、蛋白质、酶、核糖体和nanodisc。

3.根据权利要求1所述的方法,其中所述分离介质含有由下述组成的组中的至少一种:颗粒、聚合物和分离表面,并且所述至少一种靶分子连接至分离介质、颗粒、聚合物和分离表面中的至少一种。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述颗粒包括聚合物颗粒或金属胶体。

5.根据权利要求3所述的方法,其中所述聚合物具有所述至少一种靶分子的最低重量靶分子的10%或更多的分子量。

6.根据权利要求1所述的方法,进一步包括基于至少一种靶分子与至少两种不同的寡核苷酸编码分子的被编码部分之间的至少一种靶活性来分离至少两种不同的寡核苷酸编码分子。

7.根据权利要求6所述的方法,其中所述至少一种靶标活性包括所述至少一种靶分子对所述至少一种寡核苷酸编码分子的被编码部分的化学修饰。

8.根据权利要求1所述的方法,其中,

所述寡核苷酸含有至少两个编码区域,

所述至少一个被编码部分包含至少两个位置构建单元,

至少一个被编码部分的每个位置构建单元由寡核苷酸的1至5个编码区域识别;和

所述分离介质含有多孔凝胶和缓冲系统。

9.根据权利要求1所述的方法,其中,所述至少两种不同的寡核苷酸编码分子具有根据式(I)的结构,

(I) G—L—B

其中

G包括包含至少两个编码区域的寡核苷酸;

B为含有至少两个构建单元的被编码部分;

L为可操作地将G连接到B的接头;和

其中B中的每个位置构建单元根据G的1至5个编码区域的位置分别识别。

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