[发明专利]有效靶向基因组操纵剂的增强选择

权利要求书

1.一种设备，包括：

第一基于芯片的生物传感器和第二基于芯片的生物传感器，所述第一基于芯片的生物传感器和所述第二基于芯片的生物传感器分别包括一个或更多个感测表面，所述一个或更多个感测表面被配置成对核酸样品与使用靶向基因组操纵剂功能化的一个或更多个捕获表面之间的生物分子结合相互作用进行检测，所述靶向基因组操纵剂具有基因组操纵组分和靶向组分，其中，所述一个或更多个捕获表面在所述一个或更多个感测表面的感测范围内，以及其中：

所述第一基于芯片的生物传感器被配置成保持使用阻断剂可选择地培育的所述核酸样品的第一等分试样，所述阻断剂被配置成结合至与所述核酸样品的靶上序列重叠的序列；以及

所述第二基于芯片的生物传感器被配置成保持省略了所述阻断剂的所述核酸样品的第二等分试样；

测量控制器，所述测量控制器被配置成对响应于所述第一等分试样和所述第二等分试样中的所述核酸样品与第一基于芯片的生物传感器和第二基于芯片的生物传感器的功能化捕获表面上的所述靶向基因组操纵剂之间发生的生物分子结合相互作用而产生的一个或更多个第一响应信号和第二响应信号进行测量；以及

分析模块，所述分析模块被配置成基于执行所述第一响应信号和所述第二响应信号的比较来确定与所述靶向基因组操纵剂相关联的一个或更多个基因组操纵效率参数。

2.根据权利要求1所述的设备，其中，所述靶向组分包括指导RNA(“gRNA”)。

3.根据权利要求2所述的设备，其中，所述基因组操纵组分包括CRISPR相关蛋白(“Cas”)分子。

4.根据权利要求2所述的设备，其中，所述Cas分子选自Cas9、Cas12和Cas13。

5.根据权利要求2所述的设备，其中，所述靶向基因组操纵剂经由所述Cas分子附着于所述一个或更多个捕获表面。

6.根据权利要求2所述的设备，其中，所述靶向基因组操纵剂经由所述gRNA附着于所述一个或更多个捕获表面。

7.根据权利要求2所述的设备，其中，所述阻断剂选自：

与阻断RNA复合的失活Cas，所述阻断RNA被配置成结合至与所述核酸样品的靶上序列重叠的序列；以及

合成核酸类似物，所述合成核酸类似物被配置成同与所述核酸样品的所述靶上序列重叠的序列结合。

8.根据权利要求2所述的设备，其中：

与所述第一基于芯片的生物传感器和所述第二基于芯片的生物传感器相对应的感测表面包括所述一个或更多个捕获表面；

以及其中，所述第一基于芯片的生物传感器和所述第二基于芯片的生物传感器可选择地配置成在所述核酸样品处于流体未驱动状态时检测所述生物分子结合相互作用。

9.根据权利要求2所述的设备，其中，所述一个或更多个捕获表面包括功能化磁性珠状物，所述功能化磁性珠状物被配置成在与所述第一基于芯片的生物传感器和所述第二基于芯片的生物传感器相对应的感测表面的感测范围内被吸引。

10.根据权利要求2所述的设备，其中，所述测量控制器被配置成在在所述第一基于芯片的生物传感器和所述第二基于芯片的生物传感器上分别保持和培育的所述第一等分试样和所述第二等分试样的任何未结合组分被清洗掉之后测量所述一个或更多个第一响应信号和第二响应信号。

11.根据权利要求10所述的设备，其中：

所述一个或更多个第一响应信号响应于与所述核酸样品和所述靶向基因组操纵剂之间的脱靶结合相关联的结合参数的变化而改变；以及

所述一个或更多个第二响应信号响应于与所述核酸样品和所述靶向基因组操纵剂之间的靶上结合加脱靶结合相关联的结合参数的变化而改变。