[发明专利]编辑RNA的方法和组合物

权利要求书

1.60-200个核苷酸的脱氨酶招募RNA(dRNA)，其中：

a)所述dRNA包含能够与靶标RNA杂交的互补RNA序列；

b)所述dRNA能够招募脱氨酶或包含脱氨酶的构建体或包含脱氨酶的催化结构域的构建体以使所述靶标RNA中的靶标腺苷脱氨；以及

c)所述dRNA包含一种或多种化学修饰。

2.如权利要求1所述的dRNA，其中所述dRNA长于约60nt，65nt，70nt，80nt，90nt，100nt或110nt中的任何一个。

3.如权利要求1或权利要求2所述的dRNA，其包含与互补的靶标RNA区域的一个或多个错配，摆动和/或突起。

4.如权利要求1-3中任一项所述的dRNA，其中所述互补RNA序列包含与所述靶标RNA中的靶标腺苷直接相对的胞苷、腺苷或尿苷。

5.如权利要求4所述的dRNA，其中与所述靶标腺苷直接相对的所述胞苷，腺苷或尿苷位于距3'末端至少约7个核苷酸，例如距3'末端至少约8、9或10个核苷酸。

6.如权利要求4-5中任一项所述的dRNA，其中与所述靶标腺苷直接相对的所述胞苷、腺苷或尿苷位于距5'末端至少约25个核苷酸，例如距5'末端至少约30、35、40、45、50或55个核苷酸。

7.如权利要求4-6中任一项所述的dRNA，其中与所述靶标腺苷直接相对的所述胞苷、腺苷或尿苷侧翼的5'和3'序列的长度不相等。

8.如权利要求4至7中任一项所述的dRNA，其中与所述靶标腺苷直接相对的所述胞苷、腺苷或尿苷侧翼的5'序列的长度长于所述3'序列。

9.如权利要求1至8中任一项所述的dRNA，其在所述靶标RNA中包含与所述靶标腺苷直接相对的胞苷。

10.如权利要求1至9中任一项所述的dRNA，其中所述互补RNA序列包含一个或多个鸟苷，其各自与所述靶标RNA中的非靶标腺苷相对。

11.如权利要求1-10中任一项所述的dRNA，其中所述互补序列包含与所述靶标RNA中的非靶标腺苷相对的两个或更多个连续错配的核苷酸。

12.如权利要求1-11中任一项所述的dRNA，其中所述靶标RNA中的所述靶标腺苷的5'最近邻是选自U、C、A和G的核苷酸，优选U＞C≈A＞G，并且所述靶标RNA中的所述靶标腺苷的3'最近邻是选自G、C、A和U的核苷酸，优选G＞C＞A≈U。

13.如权利要求1至12中任一项所述的dRNA，其中所述靶标腺苷位于所述靶标RNA中的一个三碱基基序，所述三碱基基序选自下组：UAG，UAC，UAA，UAU，CAG，CAC，CAA，CAU，AAG，AAC，AAA，AAU，GAG，GAC，GAA和GAU。

14.如权利要求13所述的dRNA，其中所述三碱基基序是UAG，并且其中所述dRNA包含与所述三碱基基序中的尿苷直接相对的A，与所述靶标腺苷直接相对的胞苷，以及与所述三碱基基序中的鸟苷直接相对的胞苷、鸟苷或尿苷。

15.如权利要求14所述的dRNA，其包含与UAG的三碱基基序直接相对的5'-CCA-3'。

16.如权利要求1-15中任一项所述的dRNA，其中所述化学修饰包括甲基化和/或硫代磷酸酯化。

17.如权利要求16所述的dRNA，其中所述化学修饰包括2'-O-甲基化和/或核苷酸间硫代磷酸酯连接。