[发明专利]使用Tn7样转座子进行RNA引导的DNA整合在审
申请号: | 202080033551.1 | 申请日: | 2020-03-06 |
公开(公告)号: | CN113795587A | 公开(公告)日: | 2021-12-14 |
发明(设计)人: | S·H·斯特恩伯格;S·E·克洛普;P·H·佛 | 申请(专利权)人: | 纽约市哥伦比亚大学理事会 |
主分类号: | C12N15/63 | 分类号: | C12N15/63;C12N15/85;C12N15/82;A61K48/00 |
代理公司: | 北京坤瑞律师事务所 11494 | 代理人: | 封新琴 |
地址: | 美国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 使用 tn7 座子 进行 rna 引导 dna 整合 | ||
1.一种用于RNA引导的DNA整合的系统,所述系统包括:
i)工程化的CRISPR-cas系统,和/或一种或多种编码所述工程化的CRISPR-cas系统的载体,其中所述CRISPR-cas系统包括:(a)至少一种Cas蛋白,和(b)引导RNA(gRNA);和
ii)工程化的转座子系统,或一种或多种编码所述工程化的转座子系统的载体,
其中,当使用一种或多种载体时,所述CRISPR-cas系统和所述转座子系统在相同或不同的载体上。
2.如权利要求1所述的系统,其中所述至少一种cas蛋白包括Cas5、Cas6、Cas7和Cas8。
3.如权利要求1所述的系统,其中所述至少一种cas蛋白衍生自I型CRISPR-cas系统。
4.如权利要求3所述的系统,其中所述至少一种cas蛋白包括Cas5、Cas6、Cas7和Cas8。
5.如权利要求4所述的系统,其中所述I型CRISPR-cas系统是I-B型或I-F型。
6.如权利要求4所述的系统,其中所述I型CRISPR-cas系统是I-F型变体,其中所述Cas8和所述Cas5形成Cas8-Cas5融合物。
7.如权利要求1所述的系统,其中所述转座子系统包括TnsA、TnsB和TnsC。
8.如权利要求1所述的系统,其中所述转座子系统衍生自Tn7 转座子系统。
9.如权利要求8所述的系统,其中所述转座子系统包括TnsA、TnsB和TnsC。
10.如权利要求8所述的系统,其中Tn7转座子系统来源于霍乱弧菌。
11.如权利要求1所述的系统,其中所述转座子系统包括:i)TnsA、TnsB和TnsC,和ii)TnsD和/或TniQ。
12.如权利要求1所述的系统,所述系统还包括待整合的供体DNA,其中所述供体DNA包含运载物核酸序列以及第一转座子末端序列和第二转座子末端序列,并且其中所述运载物核酸序列的两侧是所述第一转座子末端序列和第二转座子末端序列。
13.如权利要求12所述的系统,其中所述第一转座子末端序列和第二转座子末端序列是Tn7转座子末端序列。
14.如权利要求1所述的系统,其中所述CRISPR-cas系统的所述至少一种cas蛋白衍生自V型CRISPR-cas系统。
15.如权利要求13所述的系统,其中所述至少一种Cas蛋白是C2c5。
16.如权利要求1所述的系统,其中所述工程化的CRISPR-cas系统和所述工程化的转座子系统来自I型CRISPR-cas系统和转座子系统,并且其中所述系统还包括第二工程化的CRISPR-cas系统和第二工程化的转座子系统,所述两者都来自V型CRISPR-cas系统和转座子系统。
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