[发明专利]用于艰难梭菌感染和复发性感染管理的工程化菌群失调感测益生菌在审

专利信息
申请号: 202080040068.6 申请日: 2020-04-02
公开(公告)号: CN114269928A 公开(公告)日: 2022-04-01
发明(设计)人: 许炜诠;黄仁暎;张旭 申请(专利权)人: 新加坡国立大学
主分类号: C12N15/55 分类号: C12N15/55;A61K38/50;A61K35/741;A61P31/04
代理公司: 北京坤瑞律师事务所 11494 代理人: 封新琴
地址: 新加坡*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 用于 艰难 感染 复发 性感 管理 工程 化菌群 失调 感测益生菌
【权利要求书】:

1.一种表达盒,所述表达盒包含:

i.胆盐水解酶基因,以及

ii.与所述胆盐水解酶基因可操作地连接的唾液酸响应型启动子。

2.根据权利要求1所述的表达盒,其中所述胆盐水解酶基因是来自产气荚膜梭菌的Cbh蛋白编码多核苷酸序列,其优选地编码SEQ ID NO:13中列出的氨基酸序列或其功能变体。

3.根据权利要求2所述的表达盒,其中所述Cbh蛋白编码多核苷酸序列包含与SEQ IDNO:8或SEQ ID NO:9中列出的核酸序列具有至少80%序列同一性的核酸序列。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的表达盒,其中所述唾液酸响应型启动子是来自大肠杆菌的pNanA,其优选地包含SEQ ID NO:4中列出的核酸序列或其功能变体。

5.根据权利要求4所述的表达盒,其中当在不存在唾液酸的情况下存在pNanA的表达时,将pNanA的阻遏子定位于pNanA的上游,其中优选地所述阻遏子是NanR蛋白编码多核苷酸序列,其优选地编码SEQ ID NO:11中列出的氨基酸序列或其功能变体。

6.根据权利要求5所述的表达盒,其中所述NanR蛋白编码多核苷酸序列包含与SEQ IDNO:5中列出的核酸序列具有至少80%序列同一性的核酸序列。

7.根据权利要求5或6所述的表达盒,所述表达盒还包含与NanR可操作地连接的组成型启动子,其中所述启动子选自包括以下的组:具有AraC的pBad;具有rbs2、rbs 3或rbs 5的J23108;和具有rbs 4的J23113。

8.根据权利要求7所述的表达盒,其中所述与NanR可操作地连接的组成型启动子是J23113-rbs4。

9.根据权利要求8所述的表达盒,其中所述盒包含J23113-rbs4-NanR,其优选地包含SEQ ID NO:6中列出的核酸序列或其功能变体。

10.根据权利要求5至9中任一项所述的表达盒,所述表达盒还包含激活子和启动子以增加Cbh的表达,如转录激活因子CadC蛋白编码序列和启动子pCadBA,其中CadC定位于pNanA的下游并受其控制,并且pCadBA定位于CadC的下游并与所述胆盐水解酶Cbh蛋白编码序列可操作地连接。

11.根据权利要求10所述的表达盒,其中所述激活子和启动子核酸序列在SEQ ID NO:7中列出或为其功能变体。

12.根据权利要求1至11中任一项所述的表达盒,其中所述盒包含在一种或多种质粒载体中。

13.根据权利要求12所述的表达盒,其中所述质粒载体是pEaat,其优选地包含SEQ IDNO:1中列出的核酸序列或其功能变体。

14.根据权利要求1至13中任一项所述的表达盒,所述表达盒还包含抗生素抗性基因,其侧翼为FRT位点以使得所述抗生素抗性基因能够被去除。

15.根据权利要求1至14中任一项所述的表达盒,其中cbh的基因多核苷酸序列经密码子优化以在益生菌细胞中表达,如在SEQ ID NO:9中所列。

16.根据权利要求15所述的表达盒,其中cbh的基因多核苷酸序列经密码子优化以在益生菌细胞中表达,所述益生菌细胞选自包括以下的组:大肠杆菌物种、拟杆菌属物种、梭菌属物种、栖粪杆菌属物种、乳酸乳球菌和乳杆菌属物种。

17.根据权利要求1至16中任一项所述的表达盒用于重组产生胆盐水解酶蛋白的用途。

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