[发明专利]用于检测头颈部表皮样癌的唾液生物标志物

说明书

本发明涉及唾液或呼吸样本中属于拟普雷沃菌属、普雷沃菌属、弯曲菌属、罗氏菌属、卡氏菌属、卟啉单胞菌属、依赖杆菌属或其任何组合的细菌的水平或浓度用于诊断患者的癌或表皮样癌、尤其是头颈部表皮样癌或获取使得能够进行这种诊断的有用数据的体外用途。

技术领域

本发明涉及唾液样本中的生物标志物或生物标志物的组合，其一方面有助于头颈部表皮样癌的诊断，另一方面预测对患有该疾病的对象的治疗的反应。

背景技术

头颈部表皮样癌(Epidermoid Cancer of the Head and Neck)是一种起源于覆盖呼吸消化道粘膜的上皮的恶性肿瘤实体。其年发病率为700000名患者，在发病率较高的癌症中世界排名第六。2013年美国新检测出的53640例头颈部肿瘤(口腔、咽部和喉部)病例中，95％对应于头颈部表皮样癌。根据2010年GLOBOCAN报告，西班牙是整个欧洲大陆中头颈部表皮样癌发病率最高的国家之一，2002年确诊了11513例头颈部表皮样癌患者就证明了这一点。

近年来，使用唾液作为某些病状或疾病的诊断工具或演变随访在生物医学领域具有重要意义。使用唾液作为诊断或随访工具的主要优点在于它是一种非侵入性方法，易于收集、价格低廉、难以改变并且在非冷藏条件下稳定。

人类口腔微生物群(唾液微生物群也是其一部分)包括一组微生物和病原体，它们是口腔的组成部分。它的功能是保护口腔，并防止疾病的发展。最近，大规模测序技术的使用使研究健康和患病患者口腔微生物群的组成变化成为可能。迄今为止进行的一些研究表明，具有肿瘤特征的部位的物种多样性较低。目前，唾液微生物群组成的结果表明，唾液中的物种，如牙龈二氧化碳嗜纤维菌(Capnocytophaga gingivalis)、产黑色素普氏菌(Prevotelle melaninogenica)和缓症链球菌(Streptococcus Mitis)与头颈部表皮样癌相关。与健康组织相比，表皮样头颈部肿瘤部位与健康组织之间的生态失调显示出放线菌(Actinobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes phylo)的减少。然而，在属或种水平上对结果的分析并没有显示出相同的趋势。

头颈部表皮样癌经常在疾病晚期才被诊断出来，因此预后很差。目前，似乎矛盾的是，在现有的手段下，还没有用于早期检测此类肿瘤的有效的方案。事实上，在本发明中提出的作为具有预测和诊断特征的可能的生物标志物的属(罗氏菌属(Rothia)、普雷沃菌属(Prevotella)、拟普雷沃菌属(Alloprevotella)、弯曲菌属(Campylobacter)、卡氏菌属(Catonella)、卟啉单胞菌属(Porphylomona)和依赖杆菌属(Fretibacterium))中，罗氏菌属是迄今为止唯一一种已被用作具有用于口腔和口咽腔中癌检测的临床指征的口腔生物标志物的生物标志物[Lim Y,Fukuma N,Totsika M,Kenny L,Morrison M,Punyadeera C:The Performance of an Oral Microbiome Biomarker Panel in Predicting OralCavity and Oropharyngeal Cancers.Front Cell Infect My 2018,8]。

因此，我们明白仍然需要提供有用的程序和工具来早期检测头颈部表皮样癌。

发明内容

在本发明中，我们分析了使用唾液微生物群作为咽喉表皮样癌的生物标志物的诊断和预后能力。为此，在“Bioithas”临床研究中心(阿利坎特)进行了一项采集了样本的临床研究。使用15.0软件进行统计分析，统计分析由一个描述部分和另一个推理部分组成(定性变量用“卡方(Chi square)”检验和定量变量用“学生T(Student's T)”检验)。斯皮尔曼的“S”相关性(Spearman'sScorrelation)用于非参数样本。最后，为了研究唾液微生物群值作为诊断和预后证据的有效性，使用ROC曲线计算最合适的截止点及其相应的灵敏度值和特异性值。