[发明专利]单一生物单元的序列信息的新型处理方法

权利要求书

1.一种方法，其发出指令使计算机执行单一生物单元的序列信息的处理，其中，接收该指令的该计算机执行如下步骤：

(A)对多个单一生物单元的序列信息的部分序列信息，基于生物谱系鉴定用序列，按照每个同一谱系进行聚类化；以及

(C)使用该单一生物单元的序列信息的部分序列信息和独立于该聚类化而生成的数据库中的该单一生物单元的序列信息，创建该单一生物单元的序列信息草图。

2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述方法还包括如下步骤：

(B)将所述数据库中的对应于所述聚类的该单一生物单元的部分序列信息追加至所述聚类中。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述(C)包括：除去一定量的包含确认到多个重复的序列部位的部分序列信息，并校正序列读段的偏差。

4.一种方法，其发出指令使计算机执行生物谱系鉴定用序列候选的筛选，其中，接收该指令的该计算机执行如下步骤：

A)从数据库提取草图中无重复的基因；

B)计算每个该基因的单拷贝基因的个数或比例；以及

C)选择该单拷贝基因的个数或比例为规定值以上的基因作为生物谱系鉴定用序列候选。

5.一种方法，其发出指令使计算机执行单一生物单元的序列信息的处理，其中，接收该指令的该计算机执行如下步骤：

(D)基于规定的判断基准，将多个单一生物单元的序列信息的部分序列信息按照品质从高至低进行排序；

(E)基于该排序，从高至低地选择该多个单一生物单元的序列信息的部分序列信息中的规定数量的集合，从该部分序列信息构建长度大于该部分序列信息的草图；以及

(E’)选择与该集合不同数量的单一生物单元的序列信息的部分序列信息的组的集合，从该部分序列信息构建长度大于该部分序列信息的草图，基于规定的判断基准，对至此所生成的草图进行选择。

6.根据权利要求5所述的方法，其中，接收该指令的该计算机执行如下步骤：

(F)将所述所选择的草图与所述(E)和(E’)中未选择的单一生物单元的序列信息的部分序列信息进行比较，选择具有未包含在该草图中的部分的序列的、单一生物单元的序列信息的部分序列信息；

(G)使用(F)中所选择的序列信息和该所选择的草图，生成更长的草图；

(G’)根据需要，重复(G)，重复进行至该更长的草图达到序列信息的全长为止；以及

(G”)根据需要，在全部的构成该草图的部分序列信息中，基于更低基准的判断基准，重复权利要求5中所述的步骤。

7.一种方法，其发出指令使计算机执行单一生物单元的序列信息的处理，其中，接收该指令的该计算机执行如下步骤：

(A)对多个单一生物单元的序列信息的部分序列信息，基于生物谱系鉴定用序列，按照每个同一谱系进行聚类化；

(H)，在该同一谱系聚类中，对构成单一生物单元的序列信息的该多个单一生物单元的序列信息的部分序列信息，基于生物谱系鉴定用序列进行评价，并在同一谱系聚类中进行再次聚类化；

(H’)将从该同一谱系聚类创建的序列信息草图与从该再次聚类化的聚类创建的序列信息草图进行比较；以及

(I)对于比较结果，基于规定的判断基准来判断(H)中的再次聚类化是否适当，当适当时，作为新群组注册在数据库中。

8.根据权利要求7所述的方法，其中，所述再次聚类化通过网络分析和社群检测来进行。