[发明专利]用于分子检测的光触发核酸构建体和方法

说明书

本公开提供了在单个反应室中实现同时多路化扩增反应和实时检测的方法、装置和系统。

交叉引用

本申请要求于2019年5月20日提交的美国临时专利申请号62/850,239的优先权，其通过引用以其全文并入本文用于所有目的。

背景技术

核酸(NA)检测是用于检测、定量和识别脱氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)分子特定序列的遗传结构的独特分析技术。NA检测具有很多应用，并且广泛用于生命科学研究和分子诊断。与应用和测试场所无关，检测样品中的遗传物质(RNA或DNA拷贝)量通常非常小而无法直接检出；因此，使用物理化学方法、生物化学方法或酶方法来增强生成的靶标特异性信号以确保更灵敏的检测是非常普遍的。其中一些方法利用分子扩增过程如聚合酶链反应(PCR)以增加靶NA的拷贝数。这些检测被分类并广为人知，通常被归类为核酸扩增检测(NAAT)。此外，扩增方法包括，例如：链置换扩增(SDA)，和基于核酸序列的扩增(NASBA)以及滚环扩增(RCA)。

NAAT方法具有多种不同的性能标准，包括分析灵敏度、特异性、检测限(LoD)、定量范围、检测动态范围(DDR)和周转时间(TAT)。不同的应用需要不同的标准，并且根据所使用的方法，总是存在折衷。例如，在感染性疾病应用中，准确识别临床标本中是否存在感染病原体至关重要。因此，人们需要NAAT方法，该方法每次检测可提供一些生物体的LOD，而定量范围则不那么重要，因为患者治疗不太依赖该信息。另一方面，在基因表达应用中，临床样品中信使RNA(mRNA)的浓度相对较大，DDR比LOD重要得多。

如今，有多种NAAT方法用于NA检测，它们使用特定的酶、试剂和温度曲线来扩增和检测特定序列。在本发明中，我们描述了一旦包括在特定NAAT方法中，就可以提高其性能标准的方法和分子结构。

发明内容

在本发明中，描述了独特的核酸(NA)构建体和方法，通过将它们并入分子检测测定中，可改进广义上定义的分析检测性能，并减少工作流程的复杂性及其周转时间。

本公开的方面提供了一种反应室，该反应室包括：包含光敏化学部分的NA构建体，其中该NA构建体处于第一分子状态，其中该NA构建体被配置为在暴露于光之后改变为第二分子状态；至少一种试剂；和至少一种酶；其中该反应室被配置为允许光到达核酸构建体。