[发明专利]涉及拴系的乙氧二羟丁酮衍生物的组合物和方法

说明书

实施方案涉及包含乙氧二羟丁酮衍生物的治疗性、诊断性或功能性复合物。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2019年5月22日提交的美国临时专利申请第62/851386号和2020年3月11日提交的美国临时专利申请第62/987932的优先权权益，其全部内容均通过引用整体并入本文。

关于联邦资助研究的声明

本发明是在美国国立卫生研究院授予的HG008935的政府支持下完成的。政府对本发明享有一定权利。

背景技术

发明领域

实施方案一般涉及分子和细胞生物学。特别地，实施方案涉及用于标记核酸的方法和组合物。

发明内容

已开发点击化学乙氧二羟丁酮衍生物(“乙氧二羟丁酮衍生物”)(例如N₃-乙氧二羟丁酮)，其通过与鸟嘌呤碱基的沃森-克里克界面反应，有效地与活细胞中的单链DNA和/或RNA连接。经标记的产物可以例如使用生物素/生物素结合配偶体或其他试剂进一步功能化和富集。

某些实施方案涉及与乙氧二羟丁酮衍生物连接的试剂或结合部分(例如治疗剂(小分子、核酸、肽等)、诊断剂(成像剂等)或功能剂(探针、标记物等))的复合物。在某些方面，化合物/乙氧二羟丁酮衍生物可具有以下通式：

在某些方面，化合物/乙氧二羟丁酮衍生物可具有式I的通式，其中E选自反应性基团、点击化学部分、结合基团或治疗剂；D是任选地接头或直接键；R是连接元件或基团；A是取代基或与第一E部分独立地选择的第二E部分；G是二羰基定义基团。

在某些方面，R可选自经取代或未取代的碳、氮、芳基、烷芳基或杂环基基团。

在某些方面，A可由一个或多于一个H、F、CF₃、CF₂H、CFH₂、CH₃、烷基基团或其组合取代(单取代、二取代等)。在某些方面，A可由接头单取代或二取代。在某些方面，A可由反应性基团例如点击化学部分、治疗剂或结合部分单取代或二取代。在其他方面，A可以是第二E基团(E₂相对于E₂)。

在某些方面，D是接头，其选自酯、酰胺、四嗪、四唑、三嗪、三唑、芳基基团、杂环、磺酰胺、硫脲，经取代或未取代的-(CH₂)_n-，其中n是1-10，并且具有0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个甲基取代基；-O(CH₂)_m-，其中m是1-10，并且具有0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个甲基取代基；-NR⁵-，其中R⁵是H或烷基例如甲基；-NR⁶CO(CH₂)_j-，其中j是1-10并且具有0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个甲基取代基，R⁶是H或烷基例如甲基；或-O(CH₂)_kR⁶-，其中k是1-10，并且具有0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个甲基取代基，R¹¹是烷基、经取代的烷基、环烷基、经取代的环烷基、杂烷基、经取代的杂烷基、芳基、经取代的芳基、杂芳基或经取代的杂芳基。D可以是-N(CH₃)-、-OCH₂-、-N(CH₃)COCH₂-或具有式VII的化学式的基团。在某些情况下，接头可以是1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或多于10个上述接头的串联体(包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或多于10个接头)。