[发明专利]通过芳香族化合物增强核酸聚合在审

专利信息
申请号: 202080053441.1 申请日: 2020-06-19
公开(公告)号: CN114144520A 公开(公告)日: 2022-03-04
发明(设计)人: M·S·科科里斯;J·塔博恩;M·纳巴维;A·雅各布斯;D·奥康奈尔;D·古德曼;L·梅里尔;J·钱德拉塞克尔 申请(专利权)人: 斯特拉托斯基因公司
主分类号: C12N11/02 分类号: C12N11/02;C12Q1/6848;C12Q1/6869;C12N15/11;C12N15/54;C07D403/14;C07D471/04;C07D249/06;C07D401/14
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司 72001 代理人: 权陆军;李唐
地址: 美国华*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 通过 芳香族 化合物 增强 核酸 聚合
【权利要求书】:

1.一种增强核酸聚合酶反应的方法,所述方法包括:

a.形成核酸聚合酶反应组合物,其包含:

i.模板核酸,

ii.核酸聚合酶,

iii.核苷酸或核苷酸类似物的混合物,和

iv.至少一种式(I)化合物;以及

b.在允许核酸聚合反应的条件下孵育所述核酸聚合酶反应组合物,其中所述至少一种式(I)化合物增加所述核酸聚合酶反应的持续合成能力、速率或保真度;

其中所述式(I)化合物由以下表示:

或其溶剂化物、水合物、互变异构体、螯合物或盐,其中:

m为1、2或3;

m′为1、2或3;

n为0、1或2;

p为0、1或2;

当X为C时W为N,或者当X为N时W为C;

为单键或双键,其中所述双键开始于W或X中为碳的任一者处;

L为连接基团;

M在每次出现时独立地选自氢、卤素和C1-C4烷基;

Ar1在每次出现时独立地选自任选地经取代的吡啶、吡嗪、哒嗪、呋喃、噻吩、萘、芴、菲、噌啉、酞嗪、喹唑啉、喹喔啉、萘啶、菲咯啉、嘌呤和咔唑,其中:

Ar1的取代基在每次出现时独立地选自卤素、-OH、-CN、-NO2、C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基、C1-C6杂烷基、C1-C6环烷基、-OR0、-CONH2、-C(O)NR1R1′、-NR1R1′、-NR1C(O)R3、-C(O)SR3、-COR3、-OC(O)R3、-C(O)OR3、硫醇、-R4-H、-SOR1、-S(O)2R1、-S(O)2NR1R1′和-NS(O)2R3

并且其中

R0在每次出现时独立地选自C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环基、经取代或未经取代的芳基、和经取代或未经取代的杂芳基;

R1和R1′在每次出现时独立地选自H、羟基、C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基、C1-C6杂烷基、C2-C6烯基、C2-C6炔基、经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的芳基烷基、和经取代或未经取代的杂芳基、-C(=NH)NH2、-CH2CO2R0、-CH2C(O)NHCH2CO2H、-CH2CH2OH、-CH2CH2NHC(O)R3、-CH2C(O)NHCH2CO2H、并且

其中R1和R1′可以一起形成杂环,包括但不限于氮杂环丁烷、吡咯烷、哌啶、哌嗪、吗啉、

R2在每次出现时独立地选自C2-C6烷基、C1-C6卤代烷基、C1-C6杂烷基、或经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环基、经取代或未经取代的芳基、经取代或未经取代的杂芳基、和经取代或未经取代的卤代烷氧基;

R3在每次出现时独立地选自H、C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基、C1-C6杂烷基、或经取代或未经取代的环烷基、经取代或未经取代的杂环基、经取代或未经取代的芳基、和经取代或未经取代的杂芳基、经取代或未经取代的卤代烷氧基、以及胍;

R4在每次出现时独立地选自被一个或多个杂原子间断的亚烷基,其中所述杂原子为O、S、NH或其组合;

Y在每次出现时独立地选自Ar2、-(CH2)3PO(OEt)2或-CH2CO2Me;

Ar2在每次出现时独立地选自经取代的5元和6元单环芳香环和包含两个在一起的单环的9元和10元稠合双环,其中两个单环中至少一个为芳香环,其中:

Ar2经G1、G2、G3、G4和G5取代,其中:

当Ar2经单基取代时,G1在每次出现时独立地选自氧代、-NH2、-COR3、-E-CO2H、-C(O)NR1R1′、-E-PO(OR1)2、和经G2、G3、G4和G5取代的芳基;

G2、G3、G4和G5在每次出现时独立地选自不存在或选自包含以下的基团:卤素、-CN、C1-C6烷基、C1-C6卤代烷基、-E-CO2H、-E-CHO、-E-C(O)R3、-E-C(O)NH(OH)、-E-C(O)NHR1、-E-CONR1R1′、-E-NR1R1′和-E-OR2,其中:

E在每次出现时独立地选自直接键和C1-C6亚烷基。

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