[发明专利]罗伊乳杆菌

说明书

具有NCIMB保藏编号42835的罗伊乳杆菌菌株(Lactobacillus reuteri)来自一种新型的系统发生进化枝，具有独特的免疫刺激特性和增强的人肠道生态性能。用于所述菌株的底物诸如棉子糖可以与所述菌株同时或分开施用。

发明领域

本发明涉及来自一种新型系统发生进化枝的罗伊乳杆菌(Lactobacillusreuteri)，其具有独特的免疫刺激特性和增强的人肠道生态性能。

发明背景

肠道微生物群是人类健康的一个关键决定因素，其直接促成病理，影响宿主对疾病的易感性。现在有大量证据表明，现代生活方式和工业化导致肠道微生物群的细菌多样性减少，这可能是由于抗生素的使用、现代临床实践、公共卫生和饮食习惯的改变等因素的综合作用(BlaserFalkow 2009；Segata,2015)。世界各地NCD(非传染性疾病)发病率的增加与富裕的生活方式有关，并且被认为至少部分是由于微生物多样性的丧失所致(Haahtela等,2015；Hanski等,2012；Rook,2013)。这些关联的机制尚不清楚，大多数关注点都集中在如“卫生学假说”等概念中的病原微生物(Jarchum等,2011)。有人提出了另一种可能更合理的假设，即在人类进化过程中，微生物已经进化成为调节我们免疫系统的重要角色。所涉及的微生物不是感染性的，而是构成我们人类微生物组的友好共生的微生物。这些微生物是通过暴露于我们自然环境中的其他人或动物和微生物群而获得的。研究人员现在同意，一系列生活方式的改变，包括剖腹产(C-section)的增加、母乳喂养的减少、家庭人数的减少以及户外时间的减少，是减少暴露于友好微生物的根本原因，同时改变的饮食和抗生素对微生物组的组成产生不利影响。

因此，需要改善肠道微生物群的细菌多样性。

罗伊乳杆菌(L.reuteri)已被证明是人类胃肠道真正的固有细菌之一(Sinkiewicz,2010)。其自然地寄居于广泛的脊椎动物，包括人、猪、仓鼠、小鼠、大鼠、狗、羊、牛和不同种类的鸟类(包括鸡)，并且发现在人泌尿生殖道和母乳中也有存在(Mitsuoka,1992)。

目前罗伊乳杆菌在西方人群中的发生率非常低，该物种只是偶尔被发现(WalterJ,2008)。有一些证据表明，在上一世纪中叶，罗伊乳杆菌在人粪便样本中的发生率较高。Gerhard Reuter和Tomonari Mitsuoka在1960年代和1970年代深入研究了人消化道的乳杆菌属(Lactobacillus)生物群，他们报告罗伊乳杆菌是当时主要的乳杆菌之一，并且经常被检测到(Mitsuoka T.,1992；Reuter G.,2001)。在较新的研究中，在人体中的低发生率表明在过去50年中，罗伊乳杆菌种群规模有所降低。

术语“进化枝”(来自古希腊语klados，“分支(branch)”)，也称作单系群，被定义为由一个共同祖先及其所有直系后代组成的一组生物，代表在“生命树”上的一个“分支”。

共同的祖先可能是一个个体、一个种群、一个物种(已灭绝或现存)等等，直到一个界，甚至更远。进化枝是嵌套的，一个接一个，每个分支依次分成更小的分支。这些分叉反映了种群分化和独立进化的进化历史。

罗伊乳杆菌物种代表乳杆菌(lactobacilli)异型发酵进化枝中的罗伊乳杆菌类群(Duar等2017b)。罗伊乳杆菌被认为在遗传和生理学已经充分表征，并且已经充分了解有助于其在谷类和肠道生态系统中的生态适应性的代谢特性(Zhao和Ganzle,2018)。

人源的罗伊乳杆菌菌株属于两个不同的MLSA进化枝，称为进化枝II和VI。进化枝II含有大多数人肠道分离株和簇以及来自反刍动物的分离株，而进化枝VI中的人菌株与来自鸡的分离株密切相关(Oh,等2010)。

发明概述

本发明提供了一种罗伊乳杆菌菌株，其具有NCIMB保藏编号42835。