[发明专利]新型CRISPR DNA靶向酶及系统

权利要求书

1.一种工程化的非天然存在的CLUST.091979成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)-Cas系统，该系统包括：

(a)CRISPR相关蛋白或编码该CRISPR相关蛋白的核酸，其中该CRISPR相关蛋白包含SEQID NO:241的氨基酸序列；以及

(b)RNA指导物，该RNA指导物包含直接重复序列和能够与靶核酸杂交的间隔子序列；

其中该CRISPR相关蛋白能够结合该RNA指导物并且能够修饰与该间隔子序列互补的该靶核酸序列。

2.如权利要求1所述的系统，其中该CRISPR相关蛋白包含与SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:14中列出的氨基酸序列至少80％(例如，81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)相同的氨基酸序列。

3.一种工程化的非天然存在的CLUST.091979成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)-Cas系统，该系统包括：

(a)CRISPR相关蛋白或编码该CRISPR相关蛋白的核酸，其中该CRISPR相关蛋白包含与SEQ ID NO:1-56中任一个中列出的氨基酸序列至少80％(例如，81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％)相同的氨基酸序列；以及

(b)RNA指导物，该RNA指导物包含直接重复序列和能够与靶核酸杂交的间隔子序列；

其中该CRISPR相关蛋白能够结合该RNA指导物并且能够修饰与该间隔子序列互补的该靶核酸序列。

4.如任一项前述权利要求所述的系统，其中该CRISPR相关蛋白包含至少一个RuvC结构域或至少一个拆分型RuvC结构域。

5.如任一项前述权利要求所述的系统，其中该CRISPR相关蛋白包含以下序列中的一种或多种：

(a)PX₁X₂X₃X₄F(SEQ ID NO:216)，其中X₁是L或M或I或C或F，X₂是Y或W或F，X₃是K或T或C或R或W或Y或H或V，并且X₄是I或L或M；

(b)RX₁X₂X₃L(SEQ ID NO:217)，其中X₁是I或L或M或Y或T或F，X₂是R或Q或K或E或S或T，并且X₃是L或I或T或C或M或K；

(c)NX₁YX₂(SEQ ID NO:218)，其中X₁是I或L或F并且X₂是K或R或V或E；

(d)KX₁X₂X₃FAX₄X₅KD(SEQ ID NO:219)，其中X₁是T或I或N或A或S或F或V，X₂是I或V或L或S，X₃是H或S或G或R，X₄是D或S或E，并且X₅是I或V或M或T或N；

(e)LX₁NX₂(SEQ ID NO:220)，其中X₁是G或S或C或T并且X₂是N或Y或K或S；

(f)PX₁X₂X₃X₄SQX₅DS(SEQ ID NO:221)，其中X₁是S或P或A，X₂是Y或S或A或P或E或Y或Q或N，X₃是F或Y或H，X₄是T或S，并且X₅是M或T或I；

(g)KX₁X₂VRX₃X₄QEX₅H(SEQ ID NO:222)，其中X₁是N或K或W或R或E或T或Y，X₂是M或R或L或S或K或V或E或T或I或D，X₃是L或R或H或P或T或K或Q或P或S或A，X₄是G或Q或N或R或K或E或I或T或S或C，并且X₅是R或W或Y或K或T或F或S或Q；以及

(h)X₁NGX₂X₃X₄DX₅NX₆X₇X₈N(SEQ ID NO:223)，其中X₁是I或K或V或L，X₂是L或M，X₃是N或H或P，X₄是A或S或C，X₅是V或Y或I或F或T或N，X₆是A或S，X₇是S或A或P，并且X₈是M或C或L或R或N或S或K或L。