[发明专利]多种分析物粪便抗原测试

说明书

用于测试粪便样品，包括少量人粪便样品中的多种不同的标志物分析物，例如多种不同的人蛋白质、核酸和其它分子标志物分析物的方法、组合物和系统。

本申请要求于2019年10月18日提交的美国临时申请序列号62/923,300的优先权，该临时申请以引用的方式并入本文中。

技术领域

本文提供了用于测试粪便样品中的多种不同的蛋白质、核酸和其它分子标志物分析物的方法、组合物和系统，例如物品套件，所述粪便样品包括少量人粪便样品，例如在粪便免疫化学测试(Fecal Immunochemical Test，FIT)样品收集装置中收集的样品。

背景技术

粪便免疫化学测试(FIT测试)是基于抗体的测定法，可检测粪便样本中的血红蛋白，广泛用于结直肠癌(colorectal cancer，CRC)筛查。有几种不同的基于实验室的或床旁FIT测试可供使用。可用的FIT测试通常使用特殊的装置从粪便样本中收集少量样品，并将样品引入装置中所含的缓冲液中，以从样品收集时间到可对样品进行测定时，使血红蛋白稳定。FIT是一种方便且经济实惠的CRC筛查选择。

虽然已经通过使用电泳和质谱法筛查相对大的样本在粪便中鉴定了可能与结直肠腺瘤和癌症相关的其它蛋白质生物标志物(参见例如授予Bosch的美国专利公布2015/0141273 A1和2017/0199196 A1，两者都以引用的方式并入本文中以达成所有目的)，但是基于实验室的和床旁FIT测试仍然限于血红蛋白测试。

发明内容

本技术提供了使用FIT样品收集装置收集和稳定和除血红蛋白之外或除血红蛋白以外的蛋白质生物标志物的方法和组合物。因此，在一些实施方案中，本技术提供了一种表征人粪便样品的方法，所述方法包括：i)提供分散样品，所述分散样品包含分散在一定体积的稳定溶液中的少量人粪便样品；和ii)测定所述分散样品中多种不同的标志物分析物的量。如本文所用，不同的标志物分析物可包含单个分子的基因座的不同部分，例如蛋白质或核酸分析物分子的不同片段或区域。在某些实施方案中，不同的标志物分析物是不同的完全不同的分子，例如独特的蛋白质和/或独特的基因或其它核酸。在优选的实施方案中，多种不同的标志物分析物包含多种不同的蛋白质标志物分析物，优选地为包含至少三种不同的蛋白质标志物分析物。

多种不同的标志物分析物可以是例如由三种不同的基因表达的蛋白质。在某些实施方案中，多种不同的标志物分析物包含不超过三种不同的标志物分析物。在一些实施方案中，多种不同的标志物分析物包含人标志物分析物，例如人蛋白质和/或核酸分析物。在优选的实施方案中，多种不同的标志物分析物由人标志物分析物组成。

本文的技术可用于分析少量粪便样品，例如使用FIT样品收集装置，例如包含用于稳定少量粪便样品的流体的FIT样品收集装置收集的粪便样品。因此，在一些实施方案中，分散样品中的稳定溶液的体积优选地是适用于FIT样品收集装置的体积，例如小于3mL，优选小于2mL。在一些实施方案中，稳定溶液的体积小于1mL。在一些实施方案中，分散样品提供在FIT样品收集装置中。

类似地，虽然用于分析的粪便样品的质量不限于任何特定的质量，但在某些实施方案中，粪便样品的质量是能够使用FIT样品收集装置收集的样品的质量。因此，在某些实施方案中，少量粪便样品的质量小于100mg，优选小于50mg，优选小于20mg。

本技术不限于例如用于在分散样品中检测的任何特定的标志物分析物。举例来说，在一些实施方案中，多种不同的标志物分析物包含多种选自由以下组成的组的人蛋白质标志物分析物：血红蛋白(Hb)、钙卫蛋白、触珠蛋白(Hp)、补体组分3(C3)、补体组分3a(C3a)、IgG结合蛋白的Fc片段(FCGBP)、抵抗素样β(RETNLB/RELM)、S100钙结合蛋白A12(S100A12)和丝氨酸蛋白酶抑制剂家族F成员2(SERPIN F2)。在一些实施方案中，多种不同的人蛋白质标志物分析物包含Hb、Hp和C3，并且在一些实施方案中，多种不同的人蛋白质标志物分析物由Hb、Hp和C3组成。