[发明专利]检测结直肠癌的方法在审
| 申请号： | 202080077651.4 | 申请日： | 2020-11-05 |
| 公开（公告）号： | CN114667355A | 公开（公告）日： | 2022-06-24 |
| 发明（设计）人： | 安城皖;吴泰祯 | 申请（专利权）人： | 基因特力株式会社 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 北京坤瑞律师事务所 11494 | 代理人： | 陈桉 |
| 地址： | 韩国大*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 检测 直肠癌 方法 | ||
1.一种提供关于诊断结直肠癌的信息的方法，所述方法包括：
(a)将样品用至少一种试剂处理，所述至少一种试剂不同地修饰甲基化SDC2(黏结蛋白聚糖2)和ADHFE1(含铁醇脱氢酶1)基因以及非甲基化SDC2和ADHFE1基因；以及
(b)用特异性扩增所述甲基化SDC2和ADHFE1基因的引物进行处理。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述试剂是亚硫酸氢盐、酸式亚硫酸盐、二亚硫酸盐或其组合。
3.根据权利要求1所述的方法，其中至少一个胞嘧啶碱基通过所述试剂的处理转化为尿嘧啶或不同于胞嘧啶的碱基。
4.根据权利要求1所述的方法，其中特异性扩增所述甲基化ADHFE1基因的所述引物包含SEQ ID NO:1或4的序列。
5.根据权利要求4所述的方法，其中特异性扩增所述甲基化ADHFE1基因的所述引物还包含SEQ ID NO:2或5的序列。
6.根据权利要求1所述的方法，其中特异性扩增所述甲基化SDC2基因的所述引物包含SEQ ID NO:10或11的序列。
7.根据权利要求1所述的方法，所述方法还包括(c)用探针进行处理，所述探针能够与使用步骤(b)中的引物特异性扩增的甲基化SDC2基因和甲基化ADHFE1基因各自互补杂交。
8.根据权利要求7所述的方法，其中所述能够与扩增的甲基化ADHFE1基因互补杂交的探针包含SEQ ID NO:3或6的序列。
9.根据权利要求7所述的方法，其中所述能够与扩增的甲基化SDC2基因互补杂交的探针包含SEQ ID NO:12的序列。
10.根据权利要求1所述的方法，其中使用选自以下的方法检测甲基化：PCR、甲基化特异性PCR、实时甲基化特异性PCR、使用甲基化DNA特异性结合蛋白的PCR、使用甲基化DNA特异性结合抗体的PCR、定量PCR、基因芯片、测序、合成法测序、和连接法测序。
11.根据权利要求7所述的方法，其中甲基化是通过检测与所述探针结合并展现荧光的材料来检测的。
12.一种用于诊断结直肠癌的组合物，所述组合物包含：
至少一种试剂，所述至少一种试剂不同地修饰甲基化SDC2(黏结蛋白聚糖2)和ADHFE1(含铁醇脱氢酶1)基因以及非甲基化SDC2和ADHFE1基因；以及
特异性扩增所述甲基化SDC2和ADHFE1基因的引物。
13.根据权利要求12所述的组合物，其中所述试剂是亚硫酸氢盐、酸式亚硫酸盐、二亚硫酸盐或其组合。
14.根据权利要求12所述的组合物，其中至少一个胞嘧啶碱基通过所述试剂的处理转化为尿嘧啶或不同于胞嘧啶的碱基。
15.根据权利要求12所述的组合物，其中特异性扩增所述甲基化ADHFE1基因的所述引物包含SEQ ID NO:1或4的序列。
16.根据权利要求12所述的组合物，其中特异性扩增所述甲基化ADHFE1基因的所述引物还包含SEQ ID NO:2或5的序列。
17.根据权利要求12所述的组合物，其中特异性扩增所述甲基化SDC2基因的所述引物包含SEQ ID NO:10或11的序列。
18.根据权利要求12所述的组合物，所述组合物还包含能够与使用所述引物特异性扩增的甲基化SDC2和ADHFE1基因各自互补杂交的探针。
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