[发明专利]用于纳米颗粒组合物的生物标记

权利要求书

1.治疗个体中癌症的方法，所述方法包括向所述个体施用有效量的包含纳米颗粒的组合物，所述纳米颗粒包含西罗莫司和白蛋白，其中所述个体基于以下被选择进行治疗：a)在TSC1或TSC2处具有mTOR失活突变；b)在选自VHL、RB1、PBRM1、KDM6A、RET、SETD2、ARID1A、BAP1、BRCA2、TP53、RB1、ATRX、FLT1、NTRK1、TLX3、KDM6A、CDH4、CDKN2C、DAXX、ERBB3、GNAS、IL7R、PDGFRB、PMS2、PTEN、SMARCA4、和YY1AP1中的基因中的任何一个处具有畸变。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述个体未用mTOR抑制剂治疗。

3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法，其中所述个体先前疗法失败。

4.根据权利要求3所述的方法，其中所述先前疗法包括施用基于铂的药剂、化学治疗剂、血管生成抑制剂、检查点抑制剂、RANKL配体抑制剂、或癌症的一线或标准疗法。

5.根据权利要求1-4中任一项所述的方法，其中TSC1或TSC2中的所述失活突变包括同型接合型缺失、双等位基因突变、剪接位点突变、移码突变、编码区中的无义突变、具有确定影响的错义突变、或TSC1或TSC2的损失或缺失。

6.根据权利要求5所述的方法，其中TSC1或TSC2中的所述失活突变包括双等位基因突变。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法，其中所述个体基于在选自TP53、RB1、ATRX、FLT1、NTRK1、TLX3、KDM6A、CDH4、CDKN2C、DAXX、ERBB3、GNAS、IL7R、PDGFRB、PMS2、PTEN、SMARCA4、和YY1AP1的基因中的任何一个处具有畸变被选择进行治疗。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述个体基于在TSC1中具有失活突变被选择进行治疗。

9.根据权利要求8所述的方法，其中所述个体基于在选自NTRK1、RB1、TP53、和PBRM1的基因中的任何一个处具有畸变被选择进行治疗。

10.根据权利要求1-9中任一项所述的方法，其中所述个体基于在TSC2中具有失活突变被选择进行治疗。

11.根据权利要求10所述的方法，其中所述个体基于在选自TP53、ATRX、DAXX、ERBB3、FLT1、GNAS、KDM6A、PMS2、PTEN、RB1、和TLX3的基因中的任何一个处具有畸变被选择进行治疗。

12.根据权利要求1-11中任一项所述的方法，其中所述个体具有小于约10的肿瘤突变负荷。

13.根据权利要求1-12中任一项所述的方法，其中所述个体具有稳定的微卫星状态。

14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，其中所述个体不包含以下中任何一项：a)在EGFR外显子19中的缺失突变；b)EGFR外显子21L858R改变；c)EGFR外显子20T790M改变；d)ALK重排；e)BRAF V600E或V600K；f)导致MET外显子14跳跃的MET单核苷酸变体或插入/缺失；g)ERBB2扩增；h)PIK3CA中的C420R、E542K、E545A、E545D、E545G、E545K、Q546E、Q546R、H1047L、H1047R、和H1047Y中的任何一个；i)BRCA1/2改变；j)FGFR2融合和/或重排；k)BRCA1、BRCA2、ATM、BARD1、BRIP1、CDK12、CHEK1、CHEK2、FANCL、PALB2、RAD51B、RAD51C、RAD51D和RAD54L中的任何一个中的突变。