[发明专利]工程化环状指导RNA在审
申请号: | 202080094276.4 | 申请日: | 2020-12-01 |
公开(公告)号: | CN115210366A | 公开(公告)日: | 2022-10-18 |
发明(设计)人: | P·马里;D·卡特里卡 | 申请(专利权)人: | 加利福尼亚大学董事会 |
主分类号: | C12N5/10 | 分类号: | C12N5/10;C12N9/22;C12N9/78;C12N9/80;C12N15/10;C12N15/82 |
代理公司: | 北京坤瑞律师事务所 11494 | 代理人: | 陈桉 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 工程 环状 指导 rna | ||
1.一种用于编辑RNA序列中的核苷酸的经工程化的指导RNA,所述经工程化的指导RNA包含:
RNA编辑实体募集结构域,
其中所述RNA编辑实体募集结构域募集RNA编辑实体,所述RNA编辑实体在与所述经工程化的指导RNA缔合时在所述RNA序列中的核苷酸的碱基上进行化学转化,从而产生经编辑的RNA序列,其中所述经工程化的指导RNA是环状的。
2.根据权利要求1所述的经工程化的指导RNA,其中所述经工程化的指导RNA进一步包含靶向结构域。
3.根据权利要求2所述的经工程化的指导RNA,其中所述靶向结构域包含长度为约20个核苷酸至约1,000个核苷酸的序列长度。
4.根据权利要求2所述的经工程化的指导RNA,其中所述靶向结构域包含长度为至少约100个核苷酸的序列长度。
5.根据权利要求1-4中任一项所述的经工程化的指导RNA,其中所述碱基上的所述化学转化导致所述经编辑的RNA序列的至少部分敲低。
6.根据权利要求5所述的经工程化的指导RNA,其中所述部分敲低包括由所述经编辑的RNA序列表达的蛋白质或其片段的水平降低。
7.根据权利要求6所述的经工程化的指导RNA,其中所述降低的水平为约5%至100%。
8.根据权利要求7所述的经工程化的指导RNA,其中所述降低的水平为约60%至100%。
9.根据权利要求5-8中任一项所述的经工程化的指导RNA,其中与其他方面相同的未经编辑的RNA序列相比,确定所述部分敲低或降低的水平,如在体外测定中所确定的。
10.根据权利要求1-8中任一项所述的经工程化的指导RNA,其中所述化学转化导致有义密码子读作终止密码子。
11.根据权利要求1-8中任一项所述的经工程化的指导RNA,其中所述化学转化导致终止密码子读作有义密码子。
12.根据权利要求1-8中任一项所述的经工程化的指导RNA,其中所述化学转化导致第一有义密码子读作第二有义密码子。
13.根据权利要求1-8中任一项所述的经工程化的指导RNA,其中所述化学转化导致第一终止密码子读作第二终止密码子。
14.根据权利要求1-13中任一项所述的经工程化的指导RNA,其中所述经工程化的指导RNA被配置成形成二级结构,其包括:茎环结构、十字形结构、立足点结构、错配凸起结构或其任何组合。
15.根据权利要求1-14中任一项所述的经工程化的指导RNA,其中所述RNA编辑实体募集结构域包含与以下的至少约20个核酸的至少约80%序列同源性:Alu结构域、APOBEC募集结构域、GluR2结构域或Cas13募集结构域。
16.根据权利要求15所述的经工程化的指导RNA,其中所述RNA编辑实体募集结构域包含与所述Alu结构域的至少约20个核酸的至少约80%序列同源性。
17.根据权利要求16所述的经工程化的指导RNA,其中所述RNA编辑实体募集结构域包含与所述Alu结构域的至少约80%序列同源性。
18.根据权利要求15所述的经工程化的指导RNA,其中所述RNA编辑实体募集结构域包含与所述APOBEC募集结构域的至少约20个核酸的至少约80%序列同源性。
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