[发明专利]一种与小麦粒长QTL连锁的SNP分子标记及应用有效
| 申请号： | 202110029196.7 | 申请日： | 2021-01-11 |
| 公开（公告）号： | CN112593007B | 公开（公告）日： | 2022-07-01 |
| 发明（设计）人： | 马建;刘航;曲翔汝;唐华苹;牟杨;邓梅;魏育明;郑有良;兰秀锦 | 申请（专利权）人： | 四川农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12N15/11;A01H1/04 |
| 代理公司： | 北京东方盛凡知识产权代理事务所(普通合伙) 11562 | 代理人： | 张换君 |
| 地址： | 611130 四*** | 国省代码： | 四川;51 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 麦粒 qtl 连锁 snp 分子 标记 应用 | ||
1.一种引物组，其特征在于，所述引物组包括两条5’端修饰不同荧光基团的特异性上游引物和一条通用下游引物；
所述两条5’端修饰不同荧光基团的特异性上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：1-2所示，所述通用下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO：3所示。
2.一种含有权利要求1所述的引物组的试剂盒。
3.一种含有权利要求1所述的引物组的小麦全基因组芯片。
4.权利要求1所述的引物组或权利要求2所述的试剂盒或权利要求3所述小麦全基因组芯片在筛选具有合适粒长的小麦品种或品系、调控小麦粒长性状、小麦粒长基因遗传分析或小麦粒长基因遗传精细定位中的应用，其特征在于，所述小麦品种为SY95-71或20828。
5.一种筛选含有小麦粒长QTL QKL.sau-1B的小麦株系方法，其特征在于，以待测植株样品的基因组DNA作为模板，利用权利要求1所述的引物组对模板进行荧光定量PCR扩增，利用扩增结果进行基因型分型；所述小麦粒长QTL QKL.sau-1B位于小麦染色体1B长臂上，在RefSeqv1.0基因组版本的物理位置为566.6-583.6Mbp；所述小麦品种为SY95-71或20828。
6.根据权利要求5所述的筛选含有小麦粒长QTL QKL.sau-1B的小麦株系方法，其特征在于，所述荧光定量PCR的反应体系为：5μL Master Mix、1.4μL混合引物、5ng模板DNA、双蒸水加至总量为10μL。
7.根据权利要求6所述的筛选含有小麦粒长QTL QKL.sau-1B的小麦株系方法，其特征在于，所述荧光定量PCR至少有3个独立的以双蒸水代替DNA模板的空白。
8.根据权利要求5所述的筛选含有小麦粒长QTL QKL.sau-1B的小麦株系方法，其特征在于，所述荧光定量PCR的反应程序为：94℃预变性15min；94℃变性20s、61℃复性延伸60s，共10个循环；94℃变性20s、55℃复性延伸60s，共26个循环。
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