[发明专利]一种定位偏分离性状的方法、装置及存储介质

说明书

本发明提供一种定位偏分离性状的方法、装置及存储介质，方法包括：导入遗传群体待定位表型数据、遗传群体父母本及子代的基因型变异信息和基因组参考信息，对参考信息进行数据窗口划分，在多个数据窗口内对变异信息进行偏分离程度分析处理，得到待比较偏分离程度信息，从变异信息中提取相对性状的偏分离效应去除变异文件和偏分离效应增加变异文件，对其进行偏分离程度分析处理，得到第一和第二偏分离程度信息，将第一和第二偏分离程度信息与待比较偏分离程度信息进行比较，根据比较结果得到偏分离性状定位区段。本发明能够快速且准确地得到偏分离性状定位区段，解决了偏分离的性状不能定位的问题。

技术领域

本发明主要涉及基因数据处理技术领域，具体涉及一种定位偏分离性状的方法、装置及存储介质。

背景技术

正向遗传学其中一个主要的方法是基于杂交群体，对控制性状的相关区段进行定位。针对单基因控制的质量性状，常常构建BC1测交分离群体以及F2自交分离群体，如果显性性状和隐性性状的分离比经过卡方检验在BC1群体子代中呈现1：1的分离，而在F2群体子代中呈现1：2：1的分离，通常对简单质量性状的定位方法有QTL定位，BSA定位，这一些方法能表现出良好的效果。但是定位一些可能影响子代存活率的性状则可能效果不显著，因为这些性状会影响子代表型的分离，即产生分离群体表型偏分离的现象，目前对于偏分离的性状不能定位的问题还没有相应的解决办法。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是针对现有技术的不足，提供一种定位偏分离性状的方法、装置及存储介质。

本发明解决上述技术问题的技术方案如下：一种定位偏分离性状的数据处理方法，包括如下步骤：

导入遗传群体待定位表型数据、遗传群体父母本及子代的基因型变异信息和基因组参考信息；

基于数据窗口划分法对所述基因组参考信息进行划分，得到多个数据窗口；

在多个数据窗口内对所述基因型变异信息进行偏分离程度分析处理，得到待比较偏分离程度信息；

将所述遗传群体待定位表型数据中的遗传群体子代划分为不同性状的亚群，以划分得到的亚群为标准从所述基因型变异信息中提取相对性状的偏分离效应去除变异文件和偏分离效应增加变异文件；

通过多个所述数据窗口对所述偏分离效应去除变异文件进行偏分离程度分析处理，得到第一偏分离程度信息，并通过多个所述数据窗口对所述偏分离效应增加变异文件进行偏分离程度分析处理，得到第二偏分离程度信息；

将所述第一偏分离程度信息和所述第二偏分离程度信息与所述待比较偏分离程度信息进行比较，根据比较结果得到偏分离性状定位区段。

本发明解决上述技术问题的另一技术方案如下：一种定位偏分离性状的装置，包括：

导入模块，用于导入遗传群体待定位表型数据、遗传群体父母本及子代的基因型变异信息和基因组参考信息；

窗口划分模块，用于基于数据窗口划分法对所述基因组参考信息进行划分，得到多个数据窗口；

处理模块，用于在多个数据窗口内对所述基因型变异信息B进行偏分离程度分析处理，得到偏分离程度信息；

将所述遗传群体待定位表型数据中的遗传群体子代划分为至少两个不同性状的亚群，以划分得到的亚群为标准从所述基因型变异信息B中提取相对性状的偏分离效应去除变异文件和偏分离效应增加变异文件；

通过多个所述数据窗口对所述偏分离效应去除变异文件进行偏分离程度分析处理，得到第一待比较偏分离程度信息，并通过多个所述数据窗口对所述偏分离效应增加变异文件进行偏分离程度分析处理，得到第二待比较偏分离程度信息；