[发明专利]与花生蔗糖含量主效QTL位点连锁的分子标记及其应用

说明书

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与花生蔗糖含量主效QTL位点连锁的分子标记及其应用。本发明的分子标记为IndelSCA08；其与QTL位点qSCA08连锁，扩增其的引物序列如SEQ ID NO.1‑2所示。当以待鉴定花生DNA为模板，利用SEQ ID NO.1‑2所示引物进行PCR扩增后，可根据扩增片段的长度判断待鉴定花生的蔗糖含量表型，从而提高高蔗糖含量花生的育种效率。

技术领域

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及与花生蔗糖含量主效QTL位点连锁的分子标记及其应用。

背景技术

花生(Arachis hypogaea L.)是重要的油料作物和经济作物。花生籽仁富含蛋白质、脂肪、碳水化合物、维生素、白藜芦醇、矿物质和植物营养素等。随着生活水平的提高和营养科学的发展，其较高的营养价值将会不断的通过科学试验被确认。近年来，花生食品加工业发展迅速，食用花生的需求也呈逐年上升趋势。食用花生品质评价重要因素之一是口味，包括甜度、香味、脆度、柔嫩度、细腻度、异味6个指标，它直接影响花生的食用体验及经济价值。其中甜度与籽仁中的可溶性糖含量紧密相关，花生籽仁中可溶性糖主要是蔗糖。研究表明，甜度与花生籽仁的口味品质相关系数达0.88，花生籽仁中蔗糖含量达到50mg/g以上时，口感较好。

在对实验室405份花生资源进行蔗糖含量测定发现，蔗糖含量表型的变异一般在15-40mg/g之间，只有7份资源材料可达到40mg/g以上，具有较大的遗传改良潜力。然而蔗糖含量是复杂的数量性状，容易受到环境的影响，通过常规方法筛选优异材料的效果不好、准确性差、效率较低。随着分子遗传学的发展，通过开发全基因组高密度的分子标记，结合表型数据，利用连锁分析方法可以在基因组上定位到多个控制目标农艺性状的QTL位点。通过QTL紧密连锁的标记对表型性状进行选择，可以提高目标性状的育种效率。然而，目前花生籽仁中蔗糖含量相关QTL报道较少，限制了分子标记辅助培育甜花生的进展。

发明内容

本发明的目的是提供一个花生蔗糖含量主效稳定的QTL位点qSCA08及其连锁的标记，用于甜花生材料的分子标记辅助选择。

具体地，本发明提供如下技术方案：

第一方面，本发明提供一种与花生蔗糖含量主效QTL位点连锁的分子标记，所述分子标记为IndelSCA08；

分子标记IndelSCA08与QTL位点qSCA08连锁，所述分子标记IndelSCA08能够通过如SEQ ID NO.1-2所示的引物对扩增得到。

第二方面，本发明提供一种用于扩增上述分子标记的引物。

本发明中所述的引物，包括如SEQ ID NO.1-2所示的序列。

第三方面，本发明提供一种含有上述引物的试剂或试剂盒。

第四方面，本发明提供一种上述分子标记或引物或试剂或试剂盒的以下任一应用：

(1)在鉴定花生蔗糖含量性状表型中的应用；

(2)在花生种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种中的应用；

(3)在花生蔗糖含量性状早期预测中的应用；

(4)在筛选或创制花生蔗糖含量性状不同的花生中的应用；

(5)在花生蔗糖含量基因分型中的应用。

第五方面，本发明提供一种鉴定花生蔗糖含量性状表型的方法，其包括：

(1)提取待鉴定花生的DNA；

(2)以DNA为模板，利用SEQ ID NO.1-2所示引物进行PCR扩增；

(3)根据PCR扩增产物中DNA片段的大小判断待鉴定花生蔗糖含量性状表型。