[发明专利]BnaSVP基因在调控油菜花期中的应用、具有不同开花期的油菜突变体材料的制备方法有效

专利信息
申请号: 202110049541.3 申请日: 2021-01-14
公开(公告)号: CN112608930B 公开(公告)日: 2022-12-13
发明(设计)人: 范楚川;周永明;翟云孤;黄会斌;许磊 申请(专利权)人: 华中农业大学
主分类号: C12N15/29 分类号: C12N15/29;C07K14/415;C12N15/82;C12N15/84;A01H5/02;A01H6/20
代理公司: 北京金智普华知识产权代理有限公司 11401 代理人: 杨采良
地址: 430000 湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: bnasvp 基因 调控 油菜 花期 中的 应用 具有 不同 开花期 突变体 材料 制备 方法
【权利要求书】:

1.具有不同开花期的油菜突变体材料的制备方法,其特征在于:克隆BnaSVP的基因组序列,利用CRISPR/CAS9技术靶向BnaSVP的四个同源拷贝,获得突变体,所述突变体材料由所述的BnaSVP的同源拷贝中BnaA09.SVP的单拷贝突变,BnaA09.SVP和BnaC04.SVP两个拷贝同时突变,BnaA09.SVP和BnaC08.SVP两个拷贝同时突变,BnaA04.SVP、BnaA09.SVP和BnaC08.SVP三个拷贝同时突变,及BnaSVP的四个拷贝同时突变所产生的基因编码区内的核苷酸序列突变获得;

其中,所述BnaSVP基因的四个拷贝的核苷酸序列分别为:SEQ ID NO.1所示的BnaA09.SVP,SEQ ID NO.2所示的BnaA04.SVP,SEQ ID NO.3所示的BnaC08.SVP,SEQ IDNO.4所示的BnaC04.SVP;

所述BnaA09.SVP的氨基酸序列见SEQ ID NO.5,所述BnaA04.SVP的氨基酸序列见SEQID NO.6,所述BnaC08.SVP的氨基酸序列见SEQ ID NO.7,所述BnaC04.SVP的氨基酸序列见SEQ ID NO.8。

2.根据权利要求1所述的具有不同开花期的油菜突变体材料的制备方法,其特征在于:

所获突变体单株为:BnaSVP17-5 aa1aa2cc1cc2 、BnaSVP29-3 aa1aa2CC1cc2 、BnaSVP52-11 aa1aa2cc1cc2 、BnaSVP48-3 AA1aa2cc1CC2 、BnaSVP38-5 AA1aa2CC1cc2 、BnaSVP25-8 AA1aa2CC1CC2。

3.获取如权利要求2中所述的突变体单株的方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤1:获取BnaSVP基因片段;

步骤2:针对BnaSVP基因的核苷酸序列设计sgRNA,并构建载体;

步骤3:将步骤2中构建的载体转化至油菜株系中,获得突变体油菜株系;

步骤4:对突变体油菜株系进行检测并测序,确定株系基因型;

步骤5:获得的突变体油菜株系种植并自交分离,获得BnaA09.SVP的单拷贝突变,BnaA09.SVP和BnaC04.SVP两个拷贝同时突变,BnaA09.SVP和BnaC08.SVP两个拷贝同时突变,BnaA04.SVP、BnaA09.SVP和BnaC08.SVP三个拷贝同时突变,及BnaSVP的四个拷贝同时突变的突变体材料;

步骤2中设计四个sgRNA,其中S1,S2,S3靶向BnaA04.SVP拷贝,S1,S2,S4靶向BnaA09.SVP,BnaC04.SVP和BnaC08.SVP拷贝。

4.根据权利要求3所述的获取突变体单株的方法,其特征在于,获得的纯合突变体的sgRNA序列为:

BnaSVP17-5 aa1aa2cc1cc2

S1

ATGAGAGGAGAGGAACTTCAAGG wt

a1 ATGAGAGGAGAGGA----CAAGG -4bp

S2

CCGTTC--TCTGCGACGCTGATGTT wt

a2-1 CCGTTCT-TCTGCGACGCTGATGTT +A

c1-1 CCGTTCTATCTGCGACGCTGATGTT +2bp

c1-2 CCGTTC------CGACGCTGATGTT -4bp

c2-1 CCGTTCT-TCTGCGACGCTGATGTT +T

c2-2 CCGTTC---CTGCGACGCTGATGTT -T

BnaSVP29-3 aa1aa2CC1cc2

S1

ATGAGAGGAGAGGAACTTCAAGG wt

a1 ATGAGAGGAGAGG------AAGG -6bp

S2

CCGTTC-TCTGCGACGCTGATGTT wt

a2 CCGTTCTTCTGCGACGCTGATGTT +T

c2-1 CCGTTCTTCTGCGACGCTGATGTT +T/58%

c2-2 CCGTTC-T—GCGACGCTGATGTT -2bp/42%

S4

CGAGAGAGAAGATTCAG-ATCAGG wt

a2 CGAGAGAGAAGATTCAGTATCAGG +T

c2 /--------------------AGG -31bp

BnaSVP52-11 aa1aa2cc1cc2

S1

ATGAGAGGAGAGGGAACTTCAAGG wt

a1-1 ATGAGAGGAGAGGGAAC-TCAAGG -T/60%

a1-2 ATGAGAGGAGAGGGAAC----AGG -4bp/40%

a2 ATGAGAGGAGAGGG-----CAAGG -5bp

S2

CCGTTCT--CTGCGACGCTGATGTT wt

a2-1 CCGTTCTTACTGCGACGCTGATGTT +2bp/74%

a2-2 CCGTTCT---TGCGACGCTGATGTT -C/10%

c1-1 CCGTTCTA-CTGCGACGCTGATGTT +A/45%

c1-2 CCGTT------GCGACGCTGATGTT -4bp/55%

c2 CCGTTCT-------ACGCTGATGTT -5bp

BnaSVP48-3 AA1aa2cc1CC2

S2

CCGTTC-TCTGCGACGCTGATGTT wt

a2 CCGTT----TGCGACGCTGATGTT -3bp

c1 CCGTTCTTCTGCGACGCTGATGTT +T

S4

CGAGAGAGAAGATTCAGATCAGG wt

c1 CGAGAGAGAAGAT-----TCAGG -5bp

BnaSVP38-5 AA1aa2CC1cc2

S2

CCGTTCT--CTGCGACGCTGATGTT wt

a2-1 CCGTTCTA---GCGACGCTGATGTT +A/60%

a2-2 CCGTTCT----GCGACGCTGATGTT -2bp/40%

c2 CCGTTCTATCTGCGACGCTGATGTT +2bp

BnaSVP25-8 AA1aa2CC1CC2

S2

CCGTTC-TCTGCGACGCTGATGTT wt

a2-1 CCGTTCTTCTGCGACGCTGATGTT +T/43%

a2-2 CCG--------------------/ -28bp/57%。

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